debian/control

   1 Source: bowtie
   2 Section: science
   3 Priority: extra
   4 Maintainer:  Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
   5 DM-Upload-Allowed: yes
   6 Uploaders: Steffen Moeller <moeller@debian.org>,
   7  Yask Gupta <yask.gupta87@gmail.com>,
   8  Andreas Tille <tille@debian.org>
   9 Build-Depends: debhelper (>= 9), help2man
  10 Standards-Version: 3.9.3
  11 Homepage: http://bowtie-bio.sourceforge.net/
  12 Vcs-Svn: svn://svn.debian.org/debian-med/trunk/packages/bowtie/trunk
  13 Vcs-Browser: http://svn.debian.org/wsvn/debian-med/trunk/packages/bowtie/trunk/
  14
  15 Package: bowtie
  16 Architecture: any
  17 Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}
  18 Suggests: bowtie-examples
  19 Description: ultrafast memory-efficient short read aligner
  20  This package addresses the problem to interpret the results from the
  21  latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly
  22  short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the
  23  challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the
  24  short stretches of DNA sequenced per run.
  25  .
  26  Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate
  27  of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with
  28  a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically
  29  about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).
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  31 Package: bowtie-examples
  32 Architecture: all
  33 Depends: ${misc:Depends}
  34 Recommends: bowtie
  35 Enhances: bowtie
  36 Description: Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner
  37  This package addresses the problem to interpret the results from the
  38  latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly
  39  short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the
  40  challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the
  41  short stretches of DNA sequenced per run.
  42  .
  43  Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate
  44  of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with
  45  a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically
  46  about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).
  47  .
  48  This package provides some example data to work with bowtie.