Imported Debian patch 0.12.7-3
[bowtie.git] / search_globals.h
1 /*
2  * search_globals.h
3  *
4  *  Created on: Dec 5, 2009
5  *      Author: Ben Langmead
6  */
7
8 #ifndef SEARCH_GLOBALS_H_
9 #define SEARCH_GLOBALS_H_
10
11 #include "threading.h"
12
13 // declared in ebwt_search.cpp
14 extern bool color;
15 extern bool colorExEnds;
16 extern bool colorSeq;
17 extern bool colorQual;
18 extern int  snpPhred;
19 extern bool showSeed;
20 extern bool quiet;
21
22 extern MUTEX_T gLock;
23
24 #endif /* SEARCH_GLOBALS_H_ */