search_globals.h

   1 /*
   2  * search_globals.h
   3  *
   4  *  Created on: Dec 5, 2009
   5  *      Author: Ben Langmead
   6  */
   7
   8 #ifndef SEARCH_GLOBALS_H_
   9 #define SEARCH_GLOBALS_H_
  10
  11 #include "threading.h"
  12
  13 // declared in ebwt_search.cpp
  14 extern bool color;
  15 extern bool colorExEnds;
  16 extern bool colorSeq;
  17 extern bool colorQual;
  18 extern int  snpPhred;
  19 extern bool showSeed;
  20 extern bool quiet;
  21
  22 extern MUTEX_T gLock;
  23
  24 #endif /* SEARCH_GLOBALS_H_ */