Report cluster results with the rest of the lane summary information.
authorDiane Trout <diane@caltech.edu>
Thu, 24 Apr 2008 00:24:26 +0000 (00:24 +0000)
committerDiane Trout <diane@caltech.edu>
Thu, 24 Apr 2008 00:24:26 +0000 (00:24 +0000)
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tree3eafa0842a8cae32f5c9078f9238ac770e8bcd7a
parent2aff9fb0af02cd5cd82a53454acf6a0bfd60f509
Report cluster results with the rest of the lane summary information.
this involved breaking names like "s_1" into their sample and lane identifiers
and then exclusively using the lane identifiers.

One complexity is that I still had to treat the lane IDs as keys into
a dictionary instead of offsets into a list, because the lanes
were labeled in the range 1..8, but python's list indexes would have
been 0..7.

I also changed the report code to return a string instead of printing
stuff to stdout, to make it easier for me to integrate it into code
to email the summary report.
scripts/runfolder.py