Set WITH_SEQUENCE as both a per-lane AND global parameter 0.4.5
authorDiane Trout <diane@caltech.edu>
Tue, 19 Oct 2010 19:35:57 +0000 (19:35 +0000)
committerDiane Trout <diane@caltech.edu>
Tue, 19 Oct 2010 19:35:57 +0000 (19:35 +0000)
commit86a66805c52c4bafb5d878d2b22604b9b9309cc8
tree2c65daaab6c658e5b36343204ae013315c979adc
parentd242342d007b534919ea733204853a1ad3370e37
Set WITH_SEQUENCE as both a per-lane AND global parameter
the per-lane version set $(lane)_WITH_SEQUENCE := TRUE in the makefiles
the gerald WITH_SEQUENCE TRUE changed the setting in the config.txt file

So lets just set both versions and hopefully we'll get sequence files
out the other end.

Let me show you my hammer...
htsworkflow/pipelines/retrieve_config.py