Attempt to be robust to not having an alignment in our RunXml file
[htsworkflow.git] / htsworkflow / pipelines /
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-rw-r--r-- 17203 bustard.py
-rw-r--r-- 18158 configure_run.py
-rw-r--r-- 2794 desplit_fastq.py
-rw-r--r-- 31561 eland.py
-rw-r--r-- 5073 firecrest.py
-rw-r--r-- 3736 genome_mapper.py
-rw-r--r-- 3212 genomemap.py
-rw-r--r-- 16748 gerald.py
-rw-r--r-- 8324 ipar.py
-rw-r--r-- 6632 qseq2fastq.py
-rw-r--r-- 1000 recipe_parser.py
-rw-r--r-- 14822 retrieve_config.py
-rw-r--r-- 13172 run_status.py
-rw-r--r-- 31029 runfolder.py
-rw-r--r-- 2361 samplekey.py
-rw-r--r-- 18469 sequences.py
-rw-r--r-- 7030 srf.py
-rw-r--r-- 7841 srf2fastq.py
-rw-r--r-- 18130 summary.py
drwxr-xr-x - test