X-Git-Url: http://woldlab.caltech.edu/gitweb/?p=pysam.git;a=blobdiff_plain;f=pysam.egg-info%2FSOURCES.txt;fp=pysam.egg-info%2FSOURCES.txt;h=6f8ca43c3ff766feb62846754803ec4f991333db;hp=0000000000000000000000000000000000000000;hb=d02fe5283ed7a93a2f76a5d6dc6e37b40c11b9b1;hpb=d828f9c9aa78e3d1687265b52de841f3f3852089 diff --git a/pysam.egg-info/SOURCES.txt b/pysam.egg-info/SOURCES.txt new file mode 100644 index 0000000..6f8ca43 --- /dev/null +++ b/pysam.egg-info/SOURCES.txt @@ -0,0 +1,146 @@ +COPYING +INSTALL +KNOWN_BUGS +MANIFEST.in +THANKS +ez_setup.py +setup.cfg +setup.py +pysam/Pileup.py +pysam/TabProxies.c +pysam/TabProxies.pxd +pysam/TabProxies.pyx +pysam/VCF.py +pysam/__init__.py +pysam/csamtools.c +pysam/csamtools.pxd +pysam/csamtools.pyx +pysam/ctabix.c +pysam/ctabix.pxd +pysam/ctabix.pyx +pysam/cvcf.c +pysam/cvcf.pxd +pysam/cvcf.pyx +pysam/namedtuple.py +pysam/pysam_util.c +pysam/pysam_util.h +pysam/tabix_util.c +pysam/version.py +pysam.egg-info/PKG-INFO +pysam.egg-info/SOURCES.txt +pysam.egg-info/dependency_links.txt +pysam.egg-info/not-zip-safe +pysam.egg-info/requires.txt +pysam.egg-info/top_level.txt +samtools/bam.c.pysam.c +samtools/bam.h +samtools/bam2bcf.c.pysam.c +samtools/bam2bcf.h +samtools/bam2bcf_indel.c.pysam.c +samtools/bam2depth.c.pysam.c +samtools/bam_aux.c.pysam.c +samtools/bam_cat.c.pysam.c +samtools/bam_color.c.pysam.c +samtools/bam_endian.h +samtools/bam_import.c.pysam.c +samtools/bam_index.c.pysam.c +samtools/bam_lpileup.c.pysam.c +samtools/bam_maqcns.c.pysam.c +samtools/bam_maqcns.h +samtools/bam_mate.c.pysam.c +samtools/bam_md.c.pysam.c +samtools/bam_pileup.c.pysam.c +samtools/bam_plcmd.c.pysam.c +samtools/bam_rmdup.c.pysam.c +samtools/bam_rmdupse.c.pysam.c +samtools/bam_sort.c.pysam.c +samtools/bam_stat.c.pysam.c +samtools/bam_tview.c.pysam.c +samtools/bedidx.c.pysam.c +samtools/bgzf.c.pysam.c +samtools/bgzf.h +samtools/cut_target.c.pysam.c +samtools/errmod.c.pysam.c +samtools/errmod.h +samtools/faidx.c.pysam.c +samtools/faidx.h +samtools/glf.c.pysam.c +samtools/glf.h +samtools/kaln.c.pysam.c +samtools/kaln.h +samtools/khash.h +samtools/klist.h +samtools/knetfile.c.pysam.c +samtools/knetfile.h +samtools/kprobaln.c.pysam.c +samtools/kprobaln.h +samtools/kseq.h +samtools/ksort.h +samtools/kstring.c.pysam.c +samtools/kstring.h +samtools/msvc_compat.h +samtools/phase.c.pysam.c +samtools/pysam.h +samtools/razf.c.pysam.c +samtools/razf.h +samtools/sam.c.pysam.c +samtools/sam.h +samtools/sam_header.c.pysam.c +samtools/sam_header.h +samtools/sam_view.c.pysam.c +samtools/sample.c.pysam.c +samtools/sample.h +samtools/bcftools/bcf.c.pysam.c +samtools/bcftools/bcf.h +samtools/bcftools/bcf2qcall.c.pysam.c +samtools/bcftools/bcfutils.c.pysam.c +samtools/bcftools/call1.c.pysam.c +samtools/bcftools/em.c.pysam.c +samtools/bcftools/fet.c.pysam.c +samtools/bcftools/index.c.pysam.c +samtools/bcftools/kfunc.c.pysam.c +samtools/bcftools/kmin.c.pysam.c +samtools/bcftools/kmin.h +samtools/bcftools/prob1.c.pysam.c +samtools/bcftools/prob1.h +samtools/bcftools/vcf.c.pysam.c +samtools/misc/md5.c.pysam.c +samtools/misc/md5.h +samtools/win32/xcurses.h +samtools/win32/zconf.h +samtools/win32/zlib.h +tabix/bam_endian.h +tabix/bedidx.c.pysam.c +tabix/bgzf.c.pysam.c +tabix/bgzf.h +tabix/bgzip.c.pysam.c +tabix/index.c.pysam.c +tabix/khash.h +tabix/knetfile.c.pysam.c +tabix/knetfile.h +tabix/kseq.h +tabix/ksort.h +tabix/kstring.c.pysam.c +tabix/kstring.h +tabix/msvc_compat.h +tabix/pysam.h +tabix/tabix.h +tests/00README.txt +tests/Makefile +tests/ex1.fa +tests/ex1.sam.gz +tests/ex10.sam +tests/ex3.sam +tests/ex4.sam +tests/ex5.sam +tests/ex6.sam +tests/ex7.sam +tests/ex8.sam +tests/ex9_fail.bam +tests/ex9_nofail.bam +tests/example.gtf.gz +tests/example.gtf.gz.tbi +tests/example.py +tests/pysam_test.py +tests/segfault_tests.py +tests/tabix_test.py \ No newline at end of file