X-Git-Url: http://woldlab.caltech.edu/gitweb/?p=pysam.git;a=blobdiff_plain;f=pysam.egg-info%2FSOURCES.txt;h=45bcda92e7a5771b41a9988695e116d1aa7ea0ba;hp=6f8ca43c3ff766feb62846754803ec4f991333db;hb=ca46ef4ba4a883c57cea62d5bf1bc021f1185109;hpb=d02fe5283ed7a93a2f76a5d6dc6e37b40c11b9b1 diff --git a/pysam.egg-info/SOURCES.txt b/pysam.egg-info/SOURCES.txt index 6f8ca43..45bcda9 100644 --- a/pysam.egg-info/SOURCES.txt +++ b/pysam.egg-info/SOURCES.txt @@ -10,7 +10,6 @@ pysam/Pileup.py pysam/TabProxies.c pysam/TabProxies.pxd pysam/TabProxies.pyx -pysam/VCF.py pysam/__init__.py pysam/csamtools.c pysam/csamtools.pxd @@ -45,12 +44,11 @@ samtools/bam_endian.h samtools/bam_import.c.pysam.c samtools/bam_index.c.pysam.c samtools/bam_lpileup.c.pysam.c -samtools/bam_maqcns.c.pysam.c -samtools/bam_maqcns.h samtools/bam_mate.c.pysam.c samtools/bam_md.c.pysam.c samtools/bam_pileup.c.pysam.c samtools/bam_plcmd.c.pysam.c +samtools/bam_reheader.c.pysam.c samtools/bam_rmdup.c.pysam.c samtools/bam_rmdupse.c.pysam.c samtools/bam_sort.c.pysam.c @@ -64,8 +62,6 @@ samtools/errmod.c.pysam.c samtools/errmod.h samtools/faidx.c.pysam.c samtools/faidx.h -samtools/glf.c.pysam.c -samtools/glf.h samtools/kaln.c.pysam.c samtools/kaln.h samtools/khash.h @@ -78,7 +74,6 @@ samtools/kseq.h samtools/ksort.h samtools/kstring.c.pysam.c samtools/kstring.h -samtools/msvc_compat.h samtools/phase.c.pysam.c samtools/pysam.h samtools/razf.c.pysam.c @@ -101,11 +96,13 @@ samtools/bcftools/index.c.pysam.c samtools/bcftools/kfunc.c.pysam.c samtools/bcftools/kmin.c.pysam.c samtools/bcftools/kmin.h +samtools/bcftools/mut.c.pysam.c samtools/bcftools/prob1.c.pysam.c samtools/bcftools/prob1.h samtools/bcftools/vcf.c.pysam.c samtools/misc/md5.c.pysam.c samtools/misc/md5.h +samtools/misc/seqtk.c.pysam.c samtools/win32/xcurses.h samtools/win32/zconf.h samtools/win32/zlib.h @@ -122,7 +119,6 @@ tabix/kseq.h tabix/ksort.h tabix/kstring.c.pysam.c tabix/kstring.h -tabix/msvc_compat.h tabix/pysam.h tabix/tabix.h tests/00README.txt