debian/changelog

   1 samtools (0.1.17-1) unstable; urgency=low
   2
   3   * New upstream release 0.1.17 (6 July, 2011).
   4   * bcftools.1 and samtools.1 merged (debian/rules, debian/samtools.manpages).
   5   * Patched the example makefile to not use samtools pileup, deprecated.
   6     (debian/control, debian/rules, debian/patches/series,
   7     debian/patches/no-pileup-tests.patch)
   8
   9  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 11 Jul 2011 21:04:30 +0900
  10
  11 samtools (0.1.16-1) unstable; urgency=low
  12
  13   * New upstream release, implementing SAM Spec v1.4.
  14   * Distribute sam.h and the other headers in /usr/include/samtools.
  15     Closes: #625622, #626044, LP: #690997.
  16
  17  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 19 May 2011 13:24:25 +0900
  18
  19 samtools (0.1.15-1) unstable; urgency=low
  20
  21   * New upstream release.
  22   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2
  23     (debian/control, no changes needed).
  24   * debian/watch directly interrogates and downloads froms SourceForge.
  25
  26  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 12 Apr 2011 19:44:41 +0900
  27
  28 samtools (0.1.14-1) unstable; urgency=low
  29
  30   * New upstream release.
  31
  32  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 29 Mar 2011 13:13:54 +0900
  33
  34 samtools (0.1.13-1) unstable; urgency=low
  35
  36   * New upstream release:
  37     - backward incompatible with VCF/BCF generated by samtools older
  38       than r921 inclusive (0.1.12a is r862);
  39     - buildable with with ld --as-needed (Closes: #606004);
  40     - the helper tool bcf-fix.pl was removed.
  41   * Install the manual page of bcftools (debian/rules,
  42     debian/samtools.manpages). Closes: #616025.
  43
  44  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 02 Mar 2011 13:54:34 +0900
  45
  46 samtools (0.1.12a-1) unstable; urgency=low
  47
  48   * New upstream release.
  49   * Use bzip2 compression for the binary packages (debian/rules).
  50   * Incremented debhelper compatibility level to 8, in case ‘--‘ is not
  51     available in earlier versions (debian/compat, debian/control).
  52
  53  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 03 Dec 2010 13:32:21 +0900
  54
  55 samtools (0.1.10-1) unstable; urgency=low
  56
  57   * New upstream release.
  58
  59  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 17 Nov 2010 20:32:40 +0900
  60
  61 samtools (0.1.9-1) unstable; urgency=low
  62
  63   * New upstream release, and new program: bcftools.
  64   * debian/rules, debian/samtools.install: install bcftools, its manpage,
  65     and bcf-fix.pl and vcfutils.pl.
  66   * debian/samtools.examples, debian/rules: install and clean new examples.
  67   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.1
  68     (debian/control, no changes needed).
  69   * Updated and reformatted debian/copyright according to latest DEP-5 draft.
  70
  71  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 01 Nov 2010 20:06:32 +0900
  72
  73 samtools (0.1.8-1) unstable; urgency=low
  74
  75   * New upstream release.
  76   * Updated the VCS fields to the current Git repository (debian/control).
  77   * Install python scripts in usr/share/samtools, and suggest python
  78     (debian/samtools.install, debian/rules, debian/control).
  79   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.0
  80     (debian/control, no changes needed).
  81   * Added notes on how the package is tested (debian/README.Debian).
  82
  83  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 14 Jul 2010 14:08:59 +0900
  84
  85 samtools (0.1.7a~dfsg-1) unstable; urgency=low
  86
  87   * New upstream release: new script sam2vcf.pl, and many other changes.
  88   * Package converted to the format ‘3.0 (quilt)’ (debian/source/format).
  89   * Wrote a manual page for razip (debian/razip.1).
  90   * Better clean the example directory to make the source package
  91     buildable twice in a row (debian/rules).
  92
  93  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 17 Nov 2009 21:38:24 +0900
  94
  95 samtools (0.1.6~dfsg-1) unstable; urgency=low
  96
  97   * New upstream release.
  98   * Upstream sources repackaged to remove the win32 directory:
  99     - The removal was done with git-import-orig in a parallel Git repository,
 100       and the corresponding debian/gbp.conf file was added to this package.
 101     - Mangled the ~dfsg string of the Debian version in debian/watch.
 102     - Added a debian/README.source file and explanations in debian/copyright.
 103
 104  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 14 Sep 2009 21:58:36 +0900
 105
 106 samtools (0.1.5c-2) unstable; urgency=low
 107
 108   * Rebuilt with -fPIC (debian/rules, README.Debian).
 109   * Small corrections to the description from upstream (debian/changelog).
 110   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.3
 111     (no changes needed).
 112
 113  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 03 Sep 2009 19:29:40 +0900
 114
 115 samtools (0.1.5c-1) unstable; urgency=low
 116
 117   * Initial release (Closes: #540453)
 118
 119  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Sun, 16 Aug 2009 14:38:20 +0900