debian/changelog

   1 samtools (0.1.17-1) UNRELEASED; urgency=low
   2
   3   * New upstream release 0.1.17 (6 July, 2011).
   4   * bcftools.1 and samtools.1 merged (debian/rules, debian/samtools.manpages).
   5
   6  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 11 Jul 2011 20:22:01 +0900
   7
   8 samtools (0.1.16-1) unstable; urgency=low
   9
  10   * New upstream release, implementing SAM Spec v1.4.
  11   * Distribute sam.h and the other headers in /usr/include/samtools.
  12     Closes: #625622, #626044, LP: #690997.
  13
  14  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 19 May 2011 13:24:25 +0900
  15
  16 samtools (0.1.15-1) unstable; urgency=low
  17
  18   * New upstream release.
  19   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2
  20     (debian/control, no changes needed).
  21   * debian/watch directly interrogates and downloads froms SourceForge.
  22
  23  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 12 Apr 2011 19:44:41 +0900
  24
  25 samtools (0.1.14-1) unstable; urgency=low
  26
  27   * New upstream release.
  28
  29  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 29 Mar 2011 13:13:54 +0900
  30
  31 samtools (0.1.13-1) unstable; urgency=low
  32
  33   * New upstream release:
  34     - backward incompatible with VCF/BCF generated by samtools older
  35       than r921 inclusive (0.1.12a is r862);
  36     - buildable with with ld --as-needed (Closes: #606004);
  37     - the helper tool bcf-fix.pl was removed.
  38   * Install the manual page of bcftools (debian/rules,
  39     debian/samtools.manpages). Closes: #616025.
  40
  41  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 02 Mar 2011 13:54:34 +0900
  42
  43 samtools (0.1.12a-1) unstable; urgency=low
  44
  45   * New upstream release.
  46   * Use bzip2 compression for the binary packages (debian/rules).
  47   * Incremented debhelper compatibility level to 8, in case ‘--‘ is not
  48     available in earlier versions (debian/compat, debian/control).
  49
  50  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 03 Dec 2010 13:32:21 +0900
  51
  52 samtools (0.1.10-1) unstable; urgency=low
  53
  54   * New upstream release.
  55
  56  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 17 Nov 2010 20:32:40 +0900
  57
  58 samtools (0.1.9-1) unstable; urgency=low
  59
  60   * New upstream release, and new program: bcftools.
  61   * debian/rules, debian/samtools.install: install bcftools, its manpage,
  62     and bcf-fix.pl and vcfutils.pl.
  63   * debian/samtools.examples, debian/rules: install and clean new examples.
  64   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.1
  65     (debian/control, no changes needed).
  66   * Updated and reformatted debian/copyright according to latest DEP-5 draft.
  67
  68  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 01 Nov 2010 20:06:32 +0900
  69
  70 samtools (0.1.8-1) unstable; urgency=low
  71
  72   * New upstream release.
  73   * Updated the VCS fields to the current Git repository (debian/control).
  74   * Install python scripts in usr/share/samtools, and suggest python
  75     (debian/samtools.install, debian/rules, debian/control).
  76   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.0
  77     (debian/control, no changes needed).
  78   * Added notes on how the package is tested (debian/README.Debian).
  79
  80  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 14 Jul 2010 14:08:59 +0900
  81
  82 samtools (0.1.7a~dfsg-1) unstable; urgency=low
  83
  84   * New upstream release: new script sam2vcf.pl, and many other changes.
  85   * Package converted to the format ‘3.0 (quilt)’ (debian/source/format).
  86   * Wrote a manual page for razip (debian/razip.1).
  87   * Better clean the example directory to make the source package
  88     buildable twice in a row (debian/rules).
  89
  90  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 17 Nov 2009 21:38:24 +0900
  91
  92 samtools (0.1.6~dfsg-1) unstable; urgency=low
  93
  94   * New upstream release.
  95   * Upstream sources repackaged to remove the win32 directory:
  96     - The removal was done with git-import-orig in a parallel Git repository,
  97       and the corresponding debian/gbp.conf file was added to this package.
  98     - Mangled the ~dfsg string of the Debian version in debian/watch.
  99     - Added a debian/README.source file and explanations in debian/copyright.
 100
 101  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 14 Sep 2009 21:58:36 +0900
 102
 103 samtools (0.1.5c-2) unstable; urgency=low
 104
 105   * Rebuilt with -fPIC (debian/rules, README.Debian).
 106   * Small corrections to the description from upstream (debian/changelog).
 107   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.3
 108     (no changes needed).
 109
 110  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 03 Sep 2009 19:29:40 +0900
 111
 112 samtools (0.1.5c-1) unstable; urgency=low
 113
 114   * Initial release (Closes: #540453)
 115
 116  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Sun, 16 Aug 2009 14:38:20 +0900