debian/changelog

   1 samtools (0.1.18-1) UNRELEASED; urgency=low
   2
   3   * New upstream release.
   4
   5  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 06 Sep 2011 15:54:07 +0900
   6
   7 samtools (0.1.17-1) unstable; urgency=low
   8
   9   * New upstream release 0.1.17 (6 July, 2011).
  10   * bcftools.1 and samtools.1 merged (debian/rules, debian/samtools.manpages).
  11   * Patched the example makefile to not use samtools pileup, deprecated.
  12     (debian/control, debian/rules, debian/patches/series,
  13     debian/patches/no-pileup-tests.patch)
  14
  15  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 11 Jul 2011 21:04:30 +0900
  16
  17 samtools (0.1.16-1) unstable; urgency=low
  18
  19   * New upstream release, implementing SAM Spec v1.4.
  20   * Distribute sam.h and the other headers in /usr/include/samtools.
  21     Closes: #625622, #626044, LP: #690997.
  22
  23  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 19 May 2011 13:24:25 +0900
  24
  25 samtools (0.1.15-1) unstable; urgency=low
  26
  27   * New upstream release.
  28   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2
  29     (debian/control, no changes needed).
  30   * debian/watch directly interrogates and downloads froms SourceForge.
  31
  32  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 12 Apr 2011 19:44:41 +0900
  33
  34 samtools (0.1.14-1) unstable; urgency=low
  35
  36   * New upstream release.
  37
  38  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 29 Mar 2011 13:13:54 +0900
  39
  40 samtools (0.1.13-1) unstable; urgency=low
  41
  42   * New upstream release:
  43     - backward incompatible with VCF/BCF generated by samtools older
  44       than r921 inclusive (0.1.12a is r862);
  45     - buildable with with ld --as-needed (Closes: #606004);
  46     - the helper tool bcf-fix.pl was removed.
  47   * Install the manual page of bcftools (debian/rules,
  48     debian/samtools.manpages). Closes: #616025.
  49
  50  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 02 Mar 2011 13:54:34 +0900
  51
  52 samtools (0.1.12a-1) unstable; urgency=low
  53
  54   * New upstream release.
  55   * Use bzip2 compression for the binary packages (debian/rules).
  56   * Incremented debhelper compatibility level to 8, in case ‘--‘ is not
  57     available in earlier versions (debian/compat, debian/control).
  58
  59  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 03 Dec 2010 13:32:21 +0900
  60
  61 samtools (0.1.10-1) unstable; urgency=low
  62
  63   * New upstream release.
  64
  65  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 17 Nov 2010 20:32:40 +0900
  66
  67 samtools (0.1.9-1) unstable; urgency=low
  68
  69   * New upstream release, and new program: bcftools.
  70   * debian/rules, debian/samtools.install: install bcftools, its manpage,
  71     and bcf-fix.pl and vcfutils.pl.
  72   * debian/samtools.examples, debian/rules: install and clean new examples.
  73   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.1
  74     (debian/control, no changes needed).
  75   * Updated and reformatted debian/copyright according to latest DEP-5 draft.
  76
  77  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 01 Nov 2010 20:06:32 +0900
  78
  79 samtools (0.1.8-1) unstable; urgency=low
  80
  81   * New upstream release.
  82   * Updated the VCS fields to the current Git repository (debian/control).
  83   * Install python scripts in usr/share/samtools, and suggest python
  84     (debian/samtools.install, debian/rules, debian/control).
  85   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.0
  86     (debian/control, no changes needed).
  87   * Added notes on how the package is tested (debian/README.Debian).
  88
  89  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 14 Jul 2010 14:08:59 +0900
  90
  91 samtools (0.1.7a~dfsg-1) unstable; urgency=low
  92
  93   * New upstream release: new script sam2vcf.pl, and many other changes.
  94   * Package converted to the format ‘3.0 (quilt)’ (debian/source/format).
  95   * Wrote a manual page for razip (debian/razip.1).
  96   * Better clean the example directory to make the source package
  97     buildable twice in a row (debian/rules).
  98
  99  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 17 Nov 2009 21:38:24 +0900
 100
 101 samtools (0.1.6~dfsg-1) unstable; urgency=low
 102
 103   * New upstream release.
 104   * Upstream sources repackaged to remove the win32 directory:
 105     - The removal was done with git-import-orig in a parallel Git repository,
 106       and the corresponding debian/gbp.conf file was added to this package.
 107     - Mangled the ~dfsg string of the Debian version in debian/watch.
 108     - Added a debian/README.source file and explanations in debian/copyright.
 109
 110  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 14 Sep 2009 21:58:36 +0900
 111
 112 samtools (0.1.5c-2) unstable; urgency=low
 113
 114   * Rebuilt with -fPIC (debian/rules, README.Debian).
 115   * Small corrections to the description from upstream (debian/changelog).
 116   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.3
 117     (no changes needed).
 118
 119  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 03 Sep 2009 19:29:40 +0900
 120
 121 samtools (0.1.5c-1) unstable; urgency=low
 122
 123   * Initial release (Closes: #540453)
 124
 125  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Sun, 16 Aug 2009 14:38:20 +0900