debian/changelog

   1 samtools (0.1.18-1) unstable; urgency=low
   2
   3   [b990d9d3] New upstream release.
   4   [d59366b9] Updated copyright statements.
   5   [aa08abe5] Compress binary packages with xz.
   6   [9a36c994] Added a DEP 3 header to debian/patches/no-pileup-tests.patch.
   7
   8  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 06 Sep 2011 16:52:04 +0900
   9
  10 samtools (0.1.17-1) unstable; urgency=low
  11
  12   * New upstream release 0.1.17 (6 July, 2011).
  13   * bcftools.1 and samtools.1 merged (debian/rules, debian/samtools.manpages).
  14   * Patched the example makefile to not use samtools pileup, deprecated.
  15     (debian/control, debian/rules, debian/patches/series,
  16     debian/patches/no-pileup-tests.patch)
  17
  18  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 11 Jul 2011 21:04:30 +0900
  19
  20 samtools (0.1.16-1) unstable; urgency=low
  21
  22   * New upstream release, implementing SAM Spec v1.4.
  23   * Distribute sam.h and the other headers in /usr/include/samtools.
  24     Closes: #625622, #626044, LP: #690997.
  25
  26  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 19 May 2011 13:24:25 +0900
  27
  28 samtools (0.1.15-1) unstable; urgency=low
  29
  30   * New upstream release.
  31   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2
  32     (debian/control, no changes needed).
  33   * debian/watch directly interrogates and downloads froms SourceForge.
  34
  35  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 12 Apr 2011 19:44:41 +0900
  36
  37 samtools (0.1.14-1) unstable; urgency=low
  38
  39   * New upstream release.
  40
  41  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 29 Mar 2011 13:13:54 +0900
  42
  43 samtools (0.1.13-1) unstable; urgency=low
  44
  45   * New upstream release:
  46     - backward incompatible with VCF/BCF generated by samtools older
  47       than r921 inclusive (0.1.12a is r862);
  48     - buildable with with ld --as-needed (Closes: #606004);
  49     - the helper tool bcf-fix.pl was removed.
  50   * Install the manual page of bcftools (debian/rules,
  51     debian/samtools.manpages). Closes: #616025.
  52
  53  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 02 Mar 2011 13:54:34 +0900
  54
  55 samtools (0.1.12a-1) unstable; urgency=low
  56
  57   * New upstream release.
  58   * Use bzip2 compression for the binary packages (debian/rules).
  59   * Incremented debhelper compatibility level to 8, in case ‘--‘ is not
  60     available in earlier versions (debian/compat, debian/control).
  61
  62  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 03 Dec 2010 13:32:21 +0900
  63
  64 samtools (0.1.10-1) unstable; urgency=low
  65
  66   * New upstream release.
  67
  68  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 17 Nov 2010 20:32:40 +0900
  69
  70 samtools (0.1.9-1) unstable; urgency=low
  71
  72   * New upstream release, and new program: bcftools.
  73   * debian/rules, debian/samtools.install: install bcftools, its manpage,
  74     and bcf-fix.pl and vcfutils.pl.
  75   * debian/samtools.examples, debian/rules: install and clean new examples.
  76   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.1
  77     (debian/control, no changes needed).
  78   * Updated and reformatted debian/copyright according to latest DEP-5 draft.
  79
  80  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 01 Nov 2010 20:06:32 +0900
  81
  82 samtools (0.1.8-1) unstable; urgency=low
  83
  84   * New upstream release.
  85   * Updated the VCS fields to the current Git repository (debian/control).
  86   * Install python scripts in usr/share/samtools, and suggest python
  87     (debian/samtools.install, debian/rules, debian/control).
  88   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.0
  89     (debian/control, no changes needed).
  90   * Added notes on how the package is tested (debian/README.Debian).
  91
  92  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 14 Jul 2010 14:08:59 +0900
  93
  94 samtools (0.1.7a~dfsg-1) unstable; urgency=low
  95
  96   * New upstream release: new script sam2vcf.pl, and many other changes.
  97   * Package converted to the format ‘3.0 (quilt)’ (debian/source/format).
  98   * Wrote a manual page for razip (debian/razip.1).
  99   * Better clean the example directory to make the source package
 100     buildable twice in a row (debian/rules).
 101
 102  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 17 Nov 2009 21:38:24 +0900
 103
 104 samtools (0.1.6~dfsg-1) unstable; urgency=low
 105
 106   * New upstream release.
 107   * Upstream sources repackaged to remove the win32 directory:
 108     - The removal was done with git-import-orig in a parallel Git repository,
 109       and the corresponding debian/gbp.conf file was added to this package.
 110     - Mangled the ~dfsg string of the Debian version in debian/watch.
 111     - Added a debian/README.source file and explanations in debian/copyright.
 112
 113  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 14 Sep 2009 21:58:36 +0900
 114
 115 samtools (0.1.5c-2) unstable; urgency=low
 116
 117   * Rebuilt with -fPIC (debian/rules, README.Debian).
 118   * Small corrections to the description from upstream (debian/changelog).
 119   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.3
 120     (no changes needed).
 121
 122  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 03 Sep 2009 19:29:40 +0900
 123
 124 samtools (0.1.5c-1) unstable; urgency=low
 125
 126   * Initial release (Closes: #540453)
 127
 128  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Sun, 16 Aug 2009 14:38:20 +0900