debian/changelog

   1 samtools (0.1.18-2) UNRELEASED; urgency=low
   2
   3   * Work in progress, see git commits.
   4
   5  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 15 Sep 2011 13:26:37 +0900
   6
   7 samtools (0.1.18-1) unstable; urgency=low
   8
   9   [b990d9d3] New upstream release.
  10   [d59366b9] Updated copyright statements.
  11   [aa08abe5] Compress binary packages with xz.
  12   [9a36c994] Added a DEP 3 header to debian/patches/no-pileup-tests.patch.
  13
  14  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 06 Sep 2011 16:52:04 +0900
  15
  16 samtools (0.1.17-1) unstable; urgency=low
  17
  18   * New upstream release 0.1.17 (6 July, 2011).
  19   * bcftools.1 and samtools.1 merged (debian/rules, debian/samtools.manpages).
  20   * Patched the example makefile to not use samtools pileup, deprecated.
  21     (debian/control, debian/rules, debian/patches/series,
  22     debian/patches/no-pileup-tests.patch)
  23
  24  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 11 Jul 2011 21:04:30 +0900
  25
  26 samtools (0.1.16-1) unstable; urgency=low
  27
  28   * New upstream release, implementing SAM Spec v1.4.
  29   * Distribute sam.h and the other headers in /usr/include/samtools.
  30     Closes: #625622, #626044, LP: #690997.
  31
  32  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 19 May 2011 13:24:25 +0900
  33
  34 samtools (0.1.15-1) unstable; urgency=low
  35
  36   * New upstream release.
  37   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.2
  38     (debian/control, no changes needed).
  39   * debian/watch directly interrogates and downloads froms SourceForge.
  40
  41  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 12 Apr 2011 19:44:41 +0900
  42
  43 samtools (0.1.14-1) unstable; urgency=low
  44
  45   * New upstream release.
  46
  47  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 29 Mar 2011 13:13:54 +0900
  48
  49 samtools (0.1.13-1) unstable; urgency=low
  50
  51   * New upstream release:
  52     - backward incompatible with VCF/BCF generated by samtools older
  53       than r921 inclusive (0.1.12a is r862);
  54     - buildable with with ld --as-needed (Closes: #606004);
  55     - the helper tool bcf-fix.pl was removed.
  56   * Install the manual page of bcftools (debian/rules,
  57     debian/samtools.manpages). Closes: #616025.
  58
  59  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 02 Mar 2011 13:54:34 +0900
  60
  61 samtools (0.1.12a-1) unstable; urgency=low
  62
  63   * New upstream release.
  64   * Use bzip2 compression for the binary packages (debian/rules).
  65   * Incremented debhelper compatibility level to 8, in case ‘--‘ is not
  66     available in earlier versions (debian/compat, debian/control).
  67
  68  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Fri, 03 Dec 2010 13:32:21 +0900
  69
  70 samtools (0.1.10-1) unstable; urgency=low
  71
  72   * New upstream release.
  73
  74  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 17 Nov 2010 20:32:40 +0900
  75
  76 samtools (0.1.9-1) unstable; urgency=low
  77
  78   * New upstream release, and new program: bcftools.
  79   * debian/rules, debian/samtools.install: install bcftools, its manpage,
  80     and bcf-fix.pl and vcfutils.pl.
  81   * debian/samtools.examples, debian/rules: install and clean new examples.
  82   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.1
  83     (debian/control, no changes needed).
  84   * Updated and reformatted debian/copyright according to latest DEP-5 draft.
  85
  86  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 01 Nov 2010 20:06:32 +0900
  87
  88 samtools (0.1.8-1) unstable; urgency=low
  89
  90   * New upstream release.
  91   * Updated the VCS fields to the current Git repository (debian/control).
  92   * Install python scripts in usr/share/samtools, and suggest python
  93     (debian/samtools.install, debian/rules, debian/control).
  94   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.9.0
  95     (debian/control, no changes needed).
  96   * Added notes on how the package is tested (debian/README.Debian).
  97
  98  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Wed, 14 Jul 2010 14:08:59 +0900
  99
 100 samtools (0.1.7a~dfsg-1) unstable; urgency=low
 101
 102   * New upstream release: new script sam2vcf.pl, and many other changes.
 103   * Package converted to the format ‘3.0 (quilt)’ (debian/source/format).
 104   * Wrote a manual page for razip (debian/razip.1).
 105   * Better clean the example directory to make the source package
 106     buildable twice in a row (debian/rules).
 107
 108  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Tue, 17 Nov 2009 21:38:24 +0900
 109
 110 samtools (0.1.6~dfsg-1) unstable; urgency=low
 111
 112   * New upstream release.
 113   * Upstream sources repackaged to remove the win32 directory:
 114     - The removal was done with git-import-orig in a parallel Git repository,
 115       and the corresponding debian/gbp.conf file was added to this package.
 116     - Mangled the ~dfsg string of the Debian version in debian/watch.
 117     - Added a debian/README.source file and explanations in debian/copyright.
 118
 119  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Mon, 14 Sep 2009 21:58:36 +0900
 120
 121 samtools (0.1.5c-2) unstable; urgency=low
 122
 123   * Rebuilt with -fPIC (debian/rules, README.Debian).
 124   * Small corrections to the description from upstream (debian/changelog).
 125   * Incremented Standards-Version to reflect conformance with Policy 3.8.3
 126     (no changes needed).
 127
 128  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Thu, 03 Sep 2009 19:29:40 +0900
 129
 130 samtools (0.1.5c-1) unstable; urgency=low
 131
 132   * Initial release (Closes: #540453)
 133
 134  -- Charles Plessy <plessy@debian.org>  Sun, 16 Aug 2009 14:38:20 +0900