debian/control

   1 Source: samtools
   2 Section: science
   3 Priority: optional
   4 Maintainer: Debian-Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org>
   5 DM-Upload-Allowed: yes
   6 Uploaders: Charles Plessy <plessy@debian.org>
   7 Build-Depends: debhelper (>= 7), cdbs, libncurses5-dev, zlib1g-dev
   8 Standards-Version: 3.8.3
   9 Homepage: http://samtools.sourceforge.net
  10 Vcs-Browser: http://git.debian.org/?p=debian-med/samtools.git
  11 Vcs-Git: git://git.debian.org/debian-med/samtools.git
  12
  13 Package: samtools
  14 Architecture: any
  15 Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}
  16 Description: processing sequence alignments in SAM and BAM formats
  17  Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments
  18  in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM
  19  (Sequence Alignment/Map) format, does sorting, merging and indexing, and allows
  20  to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream,
  21  and is able to open a BAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.
  22
  23 Package: libbam-dev
  24 Architecture: any
  25 Section: libdevel
  26 Depends: ${shlibs:Depends}, ${misc:Depends}
  27 Description: manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
  28  The BAM library provides I/O and various operations on manipulating nucleotide
  29  sequence alignments in the BAM (Binary Alignment/Mapping) or SAM (Sequence
  30  Alignment/Map) format. It now supports importing from or exporting to SAM,
  31  sorting, merging, generating pileup, and quickly retrieval of reads overlapped
  32  with a specified region.