debian/copyright

   1 Format: http://dep.debian.net/deps/dep5/
   2 Source: http://qa.debian.org/watch/sf.php/samtools/samtools-0.1.16.tar.bz2
   3
   4 Files: *
   5 Copyright:  © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
   6 License: MIT
   7
   8 License: MIT
   9  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
  10  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
  11  in the Software without restriction, including without limitation the rights
  12  to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
  13  copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  14  furnished to do so, subject to the following conditions:
  15  .
  16  The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  17  all copies or substantial portions of the Software.
  18  .
  19  THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  20  IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  21  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  22  AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  23  LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  24  OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  25  THE SOFTWARE.
  26
  27 Files: kprobaln.h, kprobaln.c
  28 Copyright: © 2003-2006, 2008-2010, by Heng Li <lh3lh3@live.co.uk>
  29 License: MIT
  30
  31 Files: bcftools/bcf.h
  32 Copyright: © 2010 Broad Institute
  33 License: MIT
  34
  35 Files: misc/export2sam.pl, bam_cat.c
  36 Copyright: © 2008–2009, Genome Research Ltd.
  37 Copyright: © 2010 Illumina, Inc.
  38 License: MIT
  39
  40 Files: bgzf.*, bgzip.c
  41 Copyright: © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  42 License: MIT
  43
  44 Files: khash.h
  45 Copyright: © 2008, 2009, 2011 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  46 License: MIT
  47
  48 Files: bcftools/kmin.?
  49 Copyright: © 2008, 2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  50 License: MIT
  51
  52 Files: knetfile.c
  53 Copyright: © 2008 by Genome Research Ltd (GRL).
  54              2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  55 License: MIT
  56
  57 Files: razf.*
  58 Name: RAZF : Random Access compressed(Z) File
  59 Copyright: 2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  60 License: NetBSD-similar
  61  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  62  modification, are permitted provided that the following conditions
  63  are met:
  64   1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  65      notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  66   2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  67      notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  68      documentation and/or other materials provided with the distribution.
  69  .
  70  THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  71  ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  72  IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  73  ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  74  FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  75  DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  76  OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  77  HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  78  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  79  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  80  SUCH DAMAGE.
  81
  82 Files: misc/md5.*
  83 Copyright: no copyright is claimed
  84 License: MD5-fourmilab
  85  This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  86  The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  87  written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  88  This code is in the public domain; do with it what you wish.
  89  .
  90  Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  91  This code has been tested against that, and is equivalent,
  92  except that you don't need to include two pages of legalese
  93  with every copy.
  94  .
  95  To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  96  MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  97  needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  98  will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  99
 100 Files: win32/xcurses.h
 101 Copyright: Public Domain
 102 License: public-domain
 103  This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
 104  which is in the public domain.
 105
 106 Files: win32/z*.h
 107 Copyright: © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
 108 License: zlib
 109  This software is provided 'as-is', without any express or implied
 110  warranty.  In no event will the authors be held liable for any damages
 111  arising from the use of this software.
 112  .
 113  Permission is granted to anyone to use this software for any purpose,
 114  including commercial applications, and to alter it and redistribute it
 115  freely, subject to the following restrictions:
 116  .
 117   1. The origin of this software must not be misrepresented; you must not
 118      claim that you wrote the original software. If you use this software
 119      in a product, an acknowledgment in the product documentation would be
 120      appreciated but is not required.
 121   2. Altered source versions must be plainly marked as such, and must not be
 122      misrepresented as being the original software.
 123   3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 124  .
 125   Jean-loup Gailly        Mark Adler
 126   jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu