debian/copyright

   1 Machine-readable license summary, see ‘http://dep.debian.net/deps/dep5/’.
   2
   3
   4 Name      :  SAMtools
   5 Contact   :  SAMtools mailing list <samtools-help@lists.sourceforge.net>
   6 Source    :  http://qa.debian.org/watch/sf.php/samtools/samtools-0.1.7a.tar.bz2
   7
   8
   9 Copyright :  © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
  10 License   :  MIT
  11
  12         Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
  13         of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
  14         in the Software without restriction, including without limitation the rights
  15         to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
  16         copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  17         furnished to do so, subject to the following conditions:
  18
  19         The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  20         all copies or substantial portions of the Software.
  21
  22         THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  23         IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  24         FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  25         AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  26         LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  27         OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  28         THE SOFTWARE.
  29
  30 Files     :  bcftools/bcf.h
  31 Copyright :  © 2010 Broad Institute
  32 License   :  MIT
  33
  34 Files: misc/export2sam.pl
  35 Copyright :  © 2008–2009, Genome Research Ltd.
  36 Copyright :  © 2010 Illumina, Inc.
  37 License   :  MIT
  38
  39
  40 Files     :  bgzf.*, bgzip.c
  41 Copyright :  © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  42 License   :  MIT
  43
  44
  45 Files     :  razf.*
  46 Name      :  RAZF : Random Access compressed(Z) File
  47 Copyright :  2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  48 License   :  Similar to NetBSD license.
  49
  50         Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  51         modification, are permitted provided that the following conditions
  52         are met:
  53         1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  54            notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  55         2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  56            notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  57            documentation and/or other materials provided with the distribution.
  58
  59         THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  60         ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  61         IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  62         ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  63         FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  64         DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  65         OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  66         HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  67         LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  68         OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  69         SUCH DAMAGE.
  70
  71
  72 Files     :  misc/md5.*
  73 License   :
  74
  75         This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  76         The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  77         written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  78         This code is in the public domain; do with it what you wish.
  79
  80         Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  81         This code has been tested against that, and is equivalent,
  82         except that you don't need to include two pages of legalese
  83         with every copy.
  84
  85         To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  86         MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  87         needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  88         will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  89
  90
  91 Files     :  win32/xcurses.h
  92 License   :  Public Domain
  93
  94         This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
  95         which is in the public domain.
  96
  97
  98 Files     :  win32/z*.h
  99 Copyright :  © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
 100 License   :  zlib
 101
 102         This software is provided 'as-is', without any express or implied
 103         warranty.  In no event will the authors be held liable for any damages
 104         arising from the use of this software.
 105
 106         Permission is granted to anyone to use this software for any purpose,
 107         including commercial applications, and to alter it and redistribute it
 108         freely, subject to the following restrictions:
 109
 110         1. The origin of this software must not be misrepresented; you must not
 111            claim that you wrote the original software. If you use this software
 112            in a product, an acknowledgment in the product documentation would be
 113            appreciated but is not required.
 114         2. Altered source versions must be plainly marked as such, and must not be
 115            misrepresented as being the original software.
 116         3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 117
 118         Jean-loup Gailly        Mark Adler
 119         jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu