debian/copyright

   1 Machine-readable license summary, see ‘http://dep.debian.net/deps/dep5/’.
   2
   3
   4 Name      :  SAMtools
   5 Contact   :  SAMtools mailing list <samtools-help@lists.sourceforge.net>
   6 Source    :  http://qa.debian.org/watch/sf.php/samtools/samtools-0.1.6.tar.bz2
   7
   8
   9 Copyright :  © 2008–2009, Genome Research Ltd.
  10 License   :  MIT
  11
  12         Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
  13         of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
  14         in the Software without restriction, including without limitation the rights
  15         to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
  16         copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  17         furnished to do so, subject to the following conditions:
  18
  19         The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  20         all copies or substantial portions of the Software.
  21
  22         THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  23         IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  24         FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  25         AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  26         LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  27         OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  28         THE SOFTWARE.
  29
  30 Files     :  bgzf.*, bgzip.c
  31 Copyright :  © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  32 License   :  MIT
  33
  34
  35 Files     :  razf.*
  36 Name      :  RAZF : Random Access compressed(Z) File
  37 Copyright :  2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  38 License   :  Similar to NetBSD license.
  39
  40         Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  41         modification, are permitted provided that the following conditions
  42         are met:
  43         1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  44            notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  45         2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  46            notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  47            documentation and/or other materials provided with the distribution.
  48
  49         THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  50         ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  51         IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  52         ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  53         FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  54         DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  55         OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  56         HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  57         LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  58         OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  59         SUCH DAMAGE.
  60
  61
  62 Files     :  misc/md5.*
  63 License   :
  64
  65         This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  66         The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  67         written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  68         This code is in the public domain; do with it what you wish.
  69
  70         Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  71         This code has been tested against that, and is equivalent,
  72         except that you don't need to include two pages of legalese
  73         with every copy.
  74
  75         To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  76         MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  77         needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  78         will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  79
  80
  81 Files     :  win32/*
  82 Removed   :  Missing source.
  83
  84         The win32 directory is present in the original upstream sources, but
  85         was removed from the Debian source package, as it contains binary files for the
  86         win32 platform without their corresponding source files.