debian/copyright

   1 Format: http://dep.debian.net/deps/dep5/
   2 Source: http://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/0.1.18/samtools-0.1.18.tar.bz2
   3
   4 Files: *
   5 Copyright: © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
   6 License: MIT
   7
   8
   9 Files: kprobaln.h kprobaln.c
  10 Copyright: © 2003-2006, 2008-2010, by Heng Li <lh3lh3@live.co.uk>
  11 License: MIT
  12
  13
  14 Files: bcftools/bcf.h
  15 Copyright: © 2010 Broad Institute
  16 License: MIT
  17
  18
  19 Files: misc/export2sam.pl bam_cat.c
  20 Copyright: © 2010 Illumina, Inc.
  21 License: MIT
  22
  23
  24 Files: bgzf.* bgzip.c
  25 Copyright: © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  26 License: MIT
  27
  28
  29 Files: khash.h kseq.h
  30 Copyright: © 2008, 2009, 2011 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  31 License: MIT
  32
  33
  34 Files: bcftools/kmin.?
  35 Copyright: © 2008, 2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  36 License: MIT
  37
  38
  39 Files: knetfile.c
  40 Copyright: © 2008 by Genome Research Ltd (GRL).
  41            2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  42 License: MIT
  43
  44
  45 Files: misc/wgsim.c
  46 Copyright: © 2008 Genome Research Ltd (GRL)
  47            © 2011 Heng Li <lh3@live.co.uk>
  48 License: MIT
  49
  50
  51 Files: razf.*
  52 Copyright: 2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  53 License: NetBSD-similar
  54  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  55  modification, are permitted provided that the following conditions
  56  are met:
  57   1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  58      notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  59   2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  60      notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  61      documentation and/or other materials provided with the distribution.
  62  .
  63  THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  64  ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  65  IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  66  ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  67  FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  68  DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  69  OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  70  HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  71  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  72  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  73  SUCH DAMAGE.
  74 Name: RAZF : Random Access compressed(Z) File
  75
  76
  77 Files: misc/md5.*
  78 Copyright: no copyright is claimed
  79 License: MD5-fourmilab
  80  This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  81  The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  82  written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  83  This code is in the public domain; do with it what you wish.
  84  .
  85  Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  86  This code has been tested against that, and is equivalent,
  87  except that you don't need to include two pages of legalese
  88  with every copy.
  89  .
  90  To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  91  MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  92  needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  93  will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  94
  95
  96 Files: win32/xcurses.h
  97 Copyright: Public Domain
  98 License: public-domain
  99  This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
 100  which is in the public domain.
 101
 102
 103 Files: win32/z*.h
 104 Copyright: © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
 105 License: zlib
 106  This software is provided 'as-is', without any express or implied
 107  warranty.  In no event will the authors be held liable for any damages
 108  arising from the use of this software.
 109  .
 110  Permission is granted to anyone to use this software for any purpose,
 111  including commercial applications, and to alter it and redistribute it
 112  freely, subject to the following restrictions:
 113  .
 114   1. The origin of this software must not be misrepresented; you must not
 115      claim that you wrote the original software. If you use this software
 116      in a product, an acknowledgment in the product documentation would be
 117      appreciated but is not required.
 118   2. Altered source versions must be plainly marked as such, and must not be
 119      misrepresented as being the original software.
 120   3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 121  .
 122   Jean-loup Gailly        Mark Adler
 123   jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu
 124
 125
 126 License: MIT
 127  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
 128  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
 129  in the Software without restriction, including without limitation the rights
 130  to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
 131  copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
 132  furnished to do so, subject to the following conditions:
 133  .
 134  The above copyright notice and this permission notice shall be included in
 135  all copies or substantial portions of the Software.
 136  .
 137  THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
 138  IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
 139  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
 140  AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
 141  LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
 142  OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
 143  THE SOFTWARE.
 144