debian/copyright

   1 Format: http://dep.debian.net/deps/dep5/
   2 Source: http://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/0.1.17/samtools-0.1.17.tar.bz2
   3
   4 Files: *
   5 Copyright: © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
   6 License: MIT
   7
   8
   9 Files: kprobaln.h kprobaln.c
  10 Copyright: © 2003-2006, 2008-2010, by Heng Li <lh3lh3@live.co.uk>
  11 License: MIT
  12
  13
  14 Files: bcftools/bcf.h
  15 Copyright: © 2010 Broad Institute
  16 License: MIT
  17
  18
  19 Files: misc/export2sam.pl bam_cat.c
  20 Copyright: © 2010 Illumina, Inc.
  21 License: MIT
  22
  23
  24 Files: bgzf.* bgzip.c
  25 Copyright: © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  26 License: MIT
  27
  28
  29 Files: khash.h
  30 Copyright: © 2008, 2009, 2011 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  31 License: MIT
  32
  33
  34 Files: bcftools/kmin.?
  35 Copyright: © 2008, 2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  36 License: MIT
  37
  38
  39 Files: knetfile.c
  40 Copyright: © 2008 by Genome Research Ltd (GRL).
  41            2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  42 License: MIT
  43
  44
  45 Files: razf.*
  46 Copyright: 2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  47 License: NetBSD-similar
  48  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  49  modification, are permitted provided that the following conditions
  50  are met:
  51   1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  52      notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  53   2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  54      notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  55      documentation and/or other materials provided with the distribution.
  56  .
  57  THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  58  ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  59  IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  60  ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  61  FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  62  DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  63  OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  64  HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  65  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  66  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  67  SUCH DAMAGE.
  68 Name: RAZF : Random Access compressed(Z) File
  69
  70
  71 Files: misc/md5.*
  72 Copyright: no copyright is claimed
  73 License: MD5-fourmilab
  74  This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  75  The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  76  written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  77  This code is in the public domain; do with it what you wish.
  78  .
  79  Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  80  This code has been tested against that, and is equivalent,
  81  except that you don't need to include two pages of legalese
  82  with every copy.
  83  .
  84  To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  85  MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  86  needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  87  will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  88
  89
  90 Files: win32/xcurses.h
  91 Copyright: Public Domain
  92 License: public-domain
  93  This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
  94  which is in the public domain.
  95
  96
  97 Files: win32/z*.h
  98 Copyright: © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
  99 License: zlib
 100  This software is provided 'as-is', without any express or implied
 101  warranty.  In no event will the authors be held liable for any damages
 102  arising from the use of this software.
 103  .
 104  Permission is granted to anyone to use this software for any purpose,
 105  including commercial applications, and to alter it and redistribute it
 106  freely, subject to the following restrictions:
 107  .
 108   1. The origin of this software must not be misrepresented; you must not
 109      claim that you wrote the original software. If you use this software
 110      in a product, an acknowledgment in the product documentation would be
 111      appreciated but is not required.
 112   2. Altered source versions must be plainly marked as such, and must not be
 113      misrepresented as being the original software.
 114   3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 115  .
 116   Jean-loup Gailly        Mark Adler
 117   jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu
 118
 119
 120 License: MIT
 121  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
 122  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
 123  in the Software without restriction, including without limitation the rights
 124  to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
 125  copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
 126  furnished to do so, subject to the following conditions:
 127  .
 128  The above copyright notice and this permission notice shall be included in
 129  all copies or substantial portions of the Software.
 130  .
 131  THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
 132  IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
 133  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
 134  AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
 135  LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
 136  OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
 137  THE SOFTWARE.
 138