debian/copyright

   1 Format: DEP-5 (beta)
   2 Source: http://qa.debian.org/watch/sf.php/samtools/samtools-0.1.12a.tar.bz2
   3 Copyright:  © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
   4 License: MIT
   5  Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
   6  of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
   7  in the Software without restriction, including without limitation the rights
   8  to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
   9  copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  10  furnished to do so, subject to the following conditions:
  11  .
  12  The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  13  all copies or substantial portions of the Software.
  14  .
  15  THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  16  IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  17  FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  18  AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  19  LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  20  OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  21  THE SOFTWARE.
  22
  23 Files: kprobaln.h, kprobaln.c
  24 Copyright: © 2003-2006, 2008-2010, by Heng Li <lh3lh3@live.co.uk>
  25 License: MIT
  26
  27 Files: bcftools/bcf.h
  28 Copyright: © 2010 Broad Institute
  29 License: MIT
  30
  31 Files: misc/export2sam.pl
  32 Copyright: © 2008–2009, Genome Research Ltd.
  33 Copyright: © 2010 Illumina, Inc.
  34 License: MIT
  35
  36 Files: bgzf.*, bgzip.c
  37 Copyright: © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  38 License: MIT
  39
  40 Files: khash.h
  41 Copyright: © 2008, 2009, 2011 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  42 License: MIT
  43
  44 Files: knetfile.c
  45 Copyright: © 2008 by Genome Research Ltd (GRL).
  46              2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
  47 License: MIT
  48
  49 Files: razf.*
  50 Name: RAZF : Random Access compressed(Z) File
  51 Copyright: 2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  52 License: Similar to NetBSD license.
  53  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  54  modification, are permitted provided that the following conditions
  55  are met:
  56   1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  57      notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  58   2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  59      notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  60      documentation and/or other materials provided with the distribution.
  61  .
  62  THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  63  ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  64  IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  65  ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  66  FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  67  DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  68  OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  69  HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  70  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  71  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  72  SUCH DAMAGE.
  73
  74 Files: misc/md5.*
  75 License:
  76  This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  77  The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  78  written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  79  This code is in the public domain; do with it what you wish.
  80  .
  81  Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  82  This code has been tested against that, and is equivalent,
  83  except that you don't need to include two pages of legalese
  84  with every copy.
  85  .
  86  To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  87  MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  88  needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  89  will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  90
  91 Files: win32/xcurses.h
  92 License: Public Domain
  93  This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
  94  which is in the public domain.
  95
  96 Files: win32/z*.h
  97 Copyright: © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
  98 License: zlib
  99  This software is provided 'as-is', without any express or implied
 100  warranty.  In no event will the authors be held liable for any damages
 101  arising from the use of this software.
 102  .
 103  Permission is granted to anyone to use this software for any purpose,
 104  including commercial applications, and to alter it and redistribute it
 105  freely, subject to the following restrictions:
 106  .
 107   1. The origin of this software must not be misrepresented; you must not
 108      claim that you wrote the original software. If you use this software
 109      in a product, an acknowledgment in the product documentation would be
 110      appreciated but is not required.
 111   2. Altered source versions must be plainly marked as such, and must not be
 112      misrepresented as being the original software.
 113   3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 114  .
 115   Jean-loup Gailly        Mark Adler
 116   jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu