debian/copyright

   1 Machine-readable license summary, see ‘http://dep.debian.net/deps/dep5/’.
   2
   3
   4 Name      :  SAMtools
   5 Contact   :  SAMtools mailing list <samtools-help@lists.sourceforge.net>
   6 Source    :  http://qa.debian.org/watch/sf.php/samtools/samtools-0.1.7a.tar.bz2
   7
   8
   9 Copyright :  © 2008–2009, Genome Research Ltd.
  10 License   :  MIT
  11
  12         Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
  13         of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
  14         in the Software without restriction, including without limitation the rights
  15         to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
  16         copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  17         furnished to do so, subject to the following conditions:
  18
  19         The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  20         all copies or substantial portions of the Software.
  21
  22         THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  23         IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  24         FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  25         AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  26         LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  27         OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  28         THE SOFTWARE.
  29
  30
  31 Files: misc/export2sam.pl
  32 Copyright :  © 2008–2009, Genome Research Ltd.
  33 Copyright :  © 2010 Illumina, Inc.
  34 License   :  MIT
  35
  36
  37 Files     :  bgzf.*, bgzip.c
  38 Copyright :  © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  39 License   :  MIT
  40
  41
  42 Files     :  razf.*
  43 Name      :  RAZF : Random Access compressed(Z) File
  44 Copyright :  2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  45 License   :  Similar to NetBSD license.
  46
  47         Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  48         modification, are permitted provided that the following conditions
  49         are met:
  50         1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  51            notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  52         2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  53            notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  54            documentation and/or other materials provided with the distribution.
  55
  56         THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  57         ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  58         IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  59         ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  60         FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  61         DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  62         OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  63         HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  64         LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  65         OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  66         SUCH DAMAGE.
  67
  68
  69 Files     :  misc/md5.*
  70 License   :
  71
  72         This code implements the MD5 message-digest algorithm.
  73         The algorithm is due to Ron Rivest. This code was
  74         written by Colin Plumb in 1993, no copyright is claimed.
  75         This code is in the public domain; do with it what you wish.
  76
  77         Equivalent code is available from RSA Data Security, Inc.
  78         This code has been tested against that, and is equivalent,
  79         except that you don't need to include two pages of legalese
  80         with every copy.
  81
  82         To compute the message digest of a chunk of bytes, declare an
  83         MD5Context structure, pass it to MD5Init, call MD5Update as
  84         needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  85         will fill a supplied 16-byte array with the digest.
  86
  87
  88 Files     :  win32/xcurses.h
  89 License   :  Public Domain
  90
  91         This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
  92         which is in the public domain.
  93
  94
  95 Files     :  win32/z*.h
  96 Copyright :  © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
  97 License   :  zlib
  98
  99         This software is provided 'as-is', without any express or implied
 100         warranty.  In no event will the authors be held liable for any damages
 101         arising from the use of this software.
 102
 103         Permission is granted to anyone to use this software for any purpose,
 104         including commercial applications, and to alter it and redistribute it
 105         freely, subject to the following restrictions:
 106
 107         1. The origin of this software must not be misrepresented; you must not
 108            claim that you wrote the original software. If you use this software
 109            in a product, an acknowledgment in the product documentation would be
 110            appreciated but is not required.
 111         2. Altered source versions must be plainly marked as such, and must not be
 112            misrepresented as being the original software.
 113         3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 114
 115         Jean-loup Gailly        Mark Adler
 116         jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu