debian/copyright

   1 Machine-readable license summary, see ‘http://dep.debian.net/deps/dep5/’.
   2
   3 Name      :  SAMtools
   4 Contact   :  SAMtools mailing list <samtools-help@lists.sourceforge.net>
   5 Source    :  http://downloads.sourceforge.net/sourceforge/samtools/samtools-0.1.5c.tar.bz2
   6
   7 Copyright :  © 2008–2009, Genome Research Ltd.
   8 License   :  MIT
   9
  10         Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
  11         of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
  12         in the Software without restriction, including without limitation the rights
  13         to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
  14         copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
  15         furnished to do so, subject to the following conditions:
  16
  17         The above copyright notice and this permission notice shall be included in
  18         all copies or substantial portions of the Software.
  19
  20         THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
  21         IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
  22         FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
  23         AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
  24         LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
  25         OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
  26         THE SOFTWARE.
  27
  28 Files     :  bgzf.*, bgzip.c
  29 Copyright :  © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
  30 License   :  MIT
  31
  32 The license of the above files have been confirmed upstream and their headers
  33 will be corrected in the next release. See:
  34 http://samtools.svn.sourceforge.net/viewvc/samtools?view=rev&revision=441
  35
  36
  37 Files     :  razf.*
  38 Name      :  RAZF : Random Access compressed(Z) File
  39 Copyright :  2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
  40 License   :  Similar to NetBSD license.
  41
  42         Redistribution and use in source and binary forms, with or without
  43         modification, are permitted provided that the following conditions
  44         are met:
  45         1. Redistributions of source code must retain the above copyright
  46            notice, this list of conditions and the following disclaimer.
  47         2. Redistributions in binary form must reproduce the above copyright
  48            notice, this list of conditions and the following disclaimer in the
  49            documentation and/or other materials provided with the distribution.
  50
  51         THIS SOFTWARE IS PROVIDED BY THE AUTHOR AND CONTRIBUTORS ``AS IS'' AND
  52         ANY EXPRESS OR IMPLIED WARRANTIES, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, THE
  53         IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE
  54         ARE DISCLAIMED.  IN NO EVENT SHALL THE AUTHOR OR CONTRIBUTORS BE LIABLE
  55         FOR ANY DIRECT, INDIRECT, INCIDENTAL, SPECIAL, EXEMPLARY, OR CONSEQUENTIAL
  56         DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, PROCUREMENT OF SUBSTITUTE GOODS
  57         OR SERVICES; LOSS OF USE, DATA, OR PROFITS; OR BUSINESS INTERRUPTION)
  58         HOWEVER CAUSED AND ON ANY THEORY OF LIABILITY, WHETHER IN CONTRACT, STRICT
  59         LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  60         OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  61         SUCH DAMAGE.
  62
  63
  64 Files     :  misc/md5.*
  65 Name      :  MD5 Message Digest Algorithm
  66 Copyright :  © 1990, RSA Data Security, Inc.
  67 License   :
  68
  69         License to copy and use this software is granted provided that
  70         it is identified as the "RSA Data Security, Inc. MD5 Message
  71         Digest Algorithm" in all material mentioning or referencing this
  72         software or this function.
  73
  74         License is also granted to make and use derivative works
  75         provided that such works are identified as "derived from the RSA
  76         Data Security, Inc. MD5 Message Digest Algorithm" in all
  77         material mentioning or referencing the derived work.
  78
  79         RSA Data Security, Inc. makes no representations concerning
  80         either the merchantability of this software or the suitability
  81         of this software for any particular purpose.  It is provided "as
  82         is" without express or implied warranty of any kind.
  83
  84         These notices must be retained in any copies of any part of this
  85         documentation and/or software.
  86
  87 The above source files for MD5 support will be replaced in the next SAMtools
  88 release by the public domain implementation of ‘http://www.fourmilab.ch/md5/’.