Merge commit 'upstream/0.1.7a.dfsg'

[samtools.git] / Makefile.mingw

diff --git a/Makefile.mingw b/Makefile.mingw
index 80e8009d17baf955252b27935323f53d0a6c2d55..f1ae1be081ee976f9a883defdb64cee1724bb9fc 100644 (file)
--- a/Makefile.mingw
+++ b/Makefile.mingw
@@ -1,13 +1,13 @@
 CC=                    gcc.exe
 AR=                    ar.exe
 CFLAGS=                -g -Wall -O2
-DFLAGS=                -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -D_CURSES_LIB=2 -D_USE_KNETFILE
+DFLAGS=                -D_CURSES_LIB=2 -D_USE_KNETFILE
 LOBJS=         bgzf.o kstring.o bam_aux.o bam.o bam_import.o sam.o bam_index.o \
                        bam_pileup.o bam_lpileup.o bam_md.o glf.o razf.o faidx.o bam_sort.o \
                        knetfile.o
 AOBJS=         bam_tview.o bam_maqcns.o bam_plcmd.o sam_view.o \
                        bam_rmdup.o bam_rmdupse.o bam_mate.o bam_stat.o bam_color.o     \
-                       bamtk.o
+                       bamtk.o kaln.o sam_header.o
 PROG=          samtools
 INCLUDES=      -Iwin32
 SUBDIRS=       .
@@ -28,8 +28,8 @@ libbam.a:$(LOBJS)
 samtools:lib $(AOBJS)
                $(CC) $(CFLAGS) -o $@ $(AOBJS) $(LIBPATH) -lm -L. -lbam -Lwin32 -lz -lcurses -lws2_32
 
-razip:razip.o razf.o
-               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ razf.o razip.o -lz
+razip:razip.o razf.o knetfile.o
+               $(CC) $(CFLAGS) -o $@ razf.o razip.o knetfile.o -lz
 
 bgzip:bgzip.o bgzf.o
                $(CC) $(CFLAGS) -o $@ bgzf.o bgzip.o -lz