Merge commit 'upstream/0.1.17'
[samtools.git] / bcftools / bcf.h
index ba6dbe9b42ae033c6b3c179a730a48312cf927dd..aeae6ca0de411f198f4ff76d7c29f99a19f54448 100644 (file)
@@ -28,6 +28,8 @@
 #ifndef BCF_H
 #define BCF_H
 
+#define BCF_VERSION "0.1.17 (r973:277)"
+
 #include <stdint.h>
 #include <zlib.h>
 
@@ -150,6 +152,8 @@ extern "C" {
        int bcf_fix_gt(bcf1_t *b);
        // update PL generated by old samtools
        int bcf_fix_pl(bcf1_t *b);
+       // convert PL to GLF-like 10-likelihood GL
+       int bcf_gl10(const bcf1_t *b, uint8_t *gl);
 
        // string hash table
        void *bcf_build_refhash(bcf_hdr_t *h);