projects / samtools.git / blobdiff
? search:
summary | shortlog | log | commit | commitdiff | tree
raw | inline | side by side
New upstream release (no new copyright holder nor license statement).
[samtools.git] / debian / copyright
diff --git a/debian/copyright b/debian/copyright
index 4fc8462a101b77b1961f679528fde29fb8370b6f..d46aaef6bb68244de88ff3245ae5cd2c724b49f3 100644 (file)
--- a/debian/copyright
+++ b/debian/copyright
@@ -1,61 +1,48 @@
 Format: http://dep.debian.net/deps/dep5/
 Format: http://dep.debian.net/deps/dep5/
-Source: http://qa.debian.org/watch/sf.php/samtools/samtools-0.1.16.tar.bz2
+Source: http://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/0.1.17/samtools-0.1.17.tar.bz2
 
 Files: *
 
 Files: *
-Copyright:  © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
+Copyright: © 2008–2010, Genome Research Ltd. (GRL)
 License: MIT
 
 License: MIT
 
-License: MIT
- Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
- of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
- in the Software without restriction, including without limitation the rights
- to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
- copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
- furnished to do so, subject to the following conditions:
- . 
- The above copyright notice and this permission notice shall be included in
- all copies or substantial portions of the Software.
- .
- THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
- IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
- FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
- AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
- LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
- OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
- THE SOFTWARE.
 
 
-Files: kprobaln.h, kprobaln.c
+Files: kprobaln.h kprobaln.c
 Copyright: © 2003-2006, 2008-2010, by Heng Li <lh3lh3@live.co.uk>
 License: MIT
 
 Copyright: © 2003-2006, 2008-2010, by Heng Li <lh3lh3@live.co.uk>
 License: MIT
 
+
 Files: bcftools/bcf.h
 Copyright: © 2010 Broad Institute
 License: MIT
 
 Files: bcftools/bcf.h
 Copyright: © 2010 Broad Institute
 License: MIT
 
-Files: misc/export2sam.pl, bam_cat.c
-Copyright: © 2008–2009, Genome Research Ltd.
+
+Files: misc/export2sam.pl bam_cat.c
 Copyright: © 2010 Illumina, Inc.
 License: MIT
 
 Copyright: © 2010 Illumina, Inc.
 License: MIT
 
-Files: bgzf.*, bgzip.c
+
+Files: bgzf.* bgzip.c
 Copyright: © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
 License: MIT
 
 Copyright: © 2008 Broad Institute / Massachusetts Institute of Technology
 License: MIT
 
+
 Files: khash.h
 Copyright: © 2008, 2009, 2011 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
 License: MIT
 
 Files: khash.h
 Copyright: © 2008, 2009, 2011 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
 License: MIT
 
+
 Files: bcftools/kmin.?
 Copyright: © 2008, 2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
 License: MIT
 
 Files: bcftools/kmin.?
 Copyright: © 2008, 2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
 License: MIT
 
+
 Files: knetfile.c
 Copyright: © 2008 by Genome Research Ltd (GRL).
 Files: knetfile.c
 Copyright: © 2008 by Genome Research Ltd (GRL).
-             2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
+           2010 by Attractive Chaos <attractor@live.co.uk>
 License: MIT
 
 License: MIT
 
+
 Files: razf.*
 Files: razf.*
-Name: RAZF : Random Access compressed(Z) File
 Copyright: 2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
 License: NetBSD-similar
  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
 Copyright: 2008, Jue Ruan <ruanjue@gmail.com>, Heng Li <lh3@sanger.ac.uk>
 License: NetBSD-similar
  Redistribution and use in source and binary forms, with or without
@@ -78,6 +65,8 @@ License: NetBSD-similar
  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  SUCH DAMAGE.
  LIABILITY, OR TORT (INCLUDING NEGLIGENCE OR OTHERWISE) ARISING IN ANY WAY
  OUT OF THE USE OF THIS SOFTWARE, EVEN IF ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
  SUCH DAMAGE.
+Name: RAZF : Random Access compressed(Z) File
+
 
 Files: misc/md5.*
 Copyright: no copyright is claimed
 
 Files: misc/md5.*
 Copyright: no copyright is claimed
@@ -97,12 +86,14 @@ License: MD5-fourmilab
  needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  will fill a supplied 16-byte array with the digest.
 
  needed on buffers full of bytes, and then call MD5Final, which
  will fill a supplied 16-byte array with the digest.
 
+
 Files: win32/xcurses.h
 Copyright: Public Domain
 License: public-domain
  This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
  which is in the public domain.
 
 Files: win32/xcurses.h
 Copyright: Public Domain
 License: public-domain
  This file is part of PDCurses (http://pdcurses.sourceforge.net/),
  which is in the public domain.
 
+
 Files: win32/z*.h 
 Copyright: © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
 License: zlib
 Files: win32/z*.h 
 Copyright: © 1995-2005 Jean-loup Gailly and Mark Adler
 License: zlib
@@ -124,3 +115,24 @@ License: zlib
  .
   Jean-loup Gailly        Mark Adler
   jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu
  .
   Jean-loup Gailly        Mark Adler
   jloup@gzip.org          madler@alumni.caltech.edu
+
+
+License: MIT
+ Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
+ of this software and associated documentation files (the "Software"), to deal
+ in the Software without restriction, including without limitation the rights
+ to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
+ copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
+ furnished to do so, subject to the following conditions:
+ . 
+ The above copyright notice and this permission notice shall be included in
+ all copies or substantial portions of the Software.
+ .
+ THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
+ IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
+ FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
+ AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
+ LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
+ OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN
+ THE SOFTWARE.
+
woldlab customizations/backport of samtools package