projects / samtools.git / tree
| -rw-r--r-- | 916 | AUTHORS | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1085 | COPYING | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 123103 | ChangeLog | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1003 | INSTALL | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 2496 | Makefile | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1592 | Makefile.mingw | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 12251 | NEWS | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 10099 | bam.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 23244 | bam.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4099 | bam_aux.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 2803 | bam_color.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1064 | bam_endian.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 14553 | bam_import.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 20475 | bam_index.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4976 | bam_lpileup.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 19982 | bam_maqcns.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1397 | bam_maqcns.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 2540 | bam_mate.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 5283 | bam_md.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 11202 | bam_pileup.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 19402 | bam_plcmd.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1465 | bam_reheader.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 5631 | bam_rmdup.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4127 | bam_rmdupse.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 11060 | bam_sort.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 2688 | bam_stat.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 12709 | bam_tview.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 5215 | bamtk.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 18794 | bgzf.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4599 | bgzf.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 5786 | bgzip.c | blob | history | raw |
| drwxr-xr-x | - | debian | tree | history |
| drwxr-xr-x | - | examples | tree | history |
| -rw-r--r-- | 10271 | faidx.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 3188 | faidx.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 5931 | glf.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1799 | glf.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 11232 | kaln.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1659 | kaln.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 16522 | khash.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 3472 | klist.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 18226 | knetfile.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 1611 | knetfile.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 8108 | kseq.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 9672 | ksort.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4009 | kstring.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 2372 | kstring.h | blob | history | raw |
| drwxr-xr-x | - | misc | tree | history |
| -rw-r--r-- | 24343 | razf.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4137 | razf.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 4098 | razip.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 5503 | sam.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 2625 | sam.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 19200 | sam_header.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 643 | sam_header.h | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 9190 | sam_view.c | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 13983 | samtools.1 | blob | history | raw |
| -rw-r--r-- | 19313 | samtools.txt | blob | history | raw |
| drwxr-xr-x | - | win32 | tree | history |