mussa_gui_seq.cc

   1 #include "mussa_gui_seq.hh"
   2 #include <sstream>
   3
   4 SeqWinMaster::SeqWinMaster(int x_size, string name, int sq_num,
   5                            vector<Sequence> *some_seqs,
   6                            list<vector<int> > some_paths,
   7                            vector<int> some_lens,
   8                            vector<motif> *some_motifs)
   9 {
  10   int seq_i;
  11
  12   x_max = x_size;
  13   // give 50 pixels of height per sequence
  14   y_max = sq_num * 50;
  15
  16   // most of this stuff is here just to pass to SeqView object
  17   ana_name = name;
  18   seq_num = sq_num;
  19   S = some_seqs;
  20   P = some_paths;
  21   seq_lens = some_lens;
  22   the_motifs = some_motifs;
  23 }
  24
  25
  26 void
  27 set_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  28 {
  29   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  30   SeqWinMaster* T= blah->swm_ptr;
  31   T->real_set_align_cb(blah->which_align);
  32 }
  33
  34
  35 void
  36 SeqWinMaster::real_set_align_cb(int which_align)
  37 {
  38   vector<int> a_path;
  39   int window_length;
  40
  41
  42   a_path = *P.begin();
  43   window_length = a_path[0];
  44   cout << window_length << endl;
  45
  46   cout << "fum1\n";
  47   seq_box->align_offsets(which_align);
  48   seq_box->redraw();
  49 }
  50
  51
  52 void
  53 show_align_cb(Fl_Widget* widg, void* the_data)
  54 {
  55   menu_align_data_bundle * blah = (menu_align_data_bundle *) the_data;
  56   SeqWinMaster* T= blah->swm_ptr;
  57   T->real_show_align_cb(blah->which_align);
  58 }
  59
  60
  61 void
  62 SeqWinMaster::real_show_align_cb(int which_align)
  63 {
  64   vector<int> a_path;
  65   int window_length;
  66
  67
  68   cout << "fumish\n";
  69   seq_box->toggle_align(which_align);
  70   seq_box->redraw();
  71 }
  72
  73
  74 void
  75 toggle_bars_cb(Fl_Button* o, void* v)
  76 {
  77   SeqWinMaster* T=(SeqWinMaster*)v;
  78   T->real_toggle_bars_cb();
  79 }
  80
  81
  82 void
  83 SeqWinMaster::real_toggle_bars_cb()
  84 {
  85   seq_box->toggle_bars();
  86 }
  87
  88
  89 void
  90 toggle_motifs_cb(Fl_Button* o, void* v)
  91 {
  92   SeqWinMaster* T=(SeqWinMaster*)v;
  93   T->real_toggle_motifs_cb();
  94 }
  95
  96
  97 void
  98 SeqWinMaster::real_toggle_motifs_cb()
  99 {
 100   seq_box->toggle_motifs();
 101 }
 102
 103
 104 void
 105 SeqWinMaster::make_window()
 106 {
 107   menu_align_data_bundle * some_menu_data;
 108
 109   vector<int> a_path;
 110   int window_length, align_number;
 111   int i;
 112   ostringstream align_id_ostr;
 113   string align_id_string;
 114   list<vector<int> >::iterator align_iter;
 115
 116   Fl_Double_Window *seq_window = new Fl_Double_Window(x_max, y_max,
 117                                                       "Mussa Sequence");
 118   //seq_window->resizable();
 119   seq_window->color(FL_WHITE);
 120   seq_window->begin();
 121
 122   // make the menu that allows alignment selection
 123   choose_align_menu = new Fl_Menu_Button(3, 2, 180, 30, "Choose Alignment");
 124   choose_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 125   choose_align_menu->box(FL_PLASTIC_UP_BOX);
 126   choose_align_menu->clear();
 127
 128   // make the menu that allows alignment selection
 129   show_align_menu = new Fl_Menu_Button(186, 2, 180, 30, "Show Alignment");
 130   show_align_menu->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 131   show_align_menu->box(FL_PLASTIC_UP_BOX);
 132   show_align_menu->clear();
 133   align_iter = P.begin();
 134   align_number = 0;
 135   while(align_iter != P.end())
 136   {
 137     some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 138     some_menu_data->swm_ptr = this;
 139     some_menu_data->which_align = align_number;
 140     align_id_ostr << (*align_iter)[0] << ": ";
 141     for(i = 1; i <= seq_num; i++)
 142       align_id_ostr << (*align_iter)[i] << ", ";
 143     align_id_string = align_id_ostr.str();
 144     choose_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 145                            (Fl_Callback *) set_align_cb,
 146                            (void*) some_menu_data);
 147     show_align_menu->add((const char*)align_id_string.c_str(), 0,
 148                            (Fl_Callback *) show_align_cb,
 149                            (void*) some_menu_data, FL_MENU_TOGGLE|FL_MENU_VALUE);
 150
 151     align_id_ostr.str("");
 152     ++align_number;
 153     ++align_iter;
 154   }
 155
 156   /*
 157   show_align_menu->add("f&ee");
 158   show_align_menu->add("f&ie");
 159   show_align_menu->add("f&oe");
 160   show_align_menu->add("f&um");
 161   */
 162
 163   Fl_Button *test_but = new Fl_Button(369, 2, 180, 30, "Toggle Motifs");
 164   test_but->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 165   test_but->box(FL_PLASTIC_UP_BOX);
 166   test_but->callback((Fl_Callback*) toggle_motifs_cb, this);
 167
 168   toggle_bars = new Fl_Button(552, 2, 180, 30, "Toggle 10bp bars");
 169   toggle_bars->color(FL_WHITE,FL_BLUE);
 170   toggle_bars->box(FL_PLASTIC_UP_BOX);
 171   toggle_bars->callback((Fl_Callback*) toggle_bars_cb, this);
 172
 173
 174   // make the view of the sequence
 175   seq_box = new SeqView(0, 34, x_max, y_max-34);
 176   seq_box->setup(ana_name, seq_num, S, P, seq_lens, the_motifs);
 177   //real_set_align_cb(2);
 178
 179   seq_window->end();
 180   Fl::visual(FL_DOUBLE|FL_INDEX);
 181   seq_window->show();
 182 }
 183
 184 /*
 185   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 186   some_menu_data->swm_ptr = this;
 187   some_menu_data->which_align = 2;
 188   choose_align_menu->add("f&ie", FL_ALT+'i', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 189                   (void*) some_menu_data);
 190
 191   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 192   some_menu_data->swm_ptr = this;
 193   some_menu_data->which_align = 3;
 194   choose_align_menu->add("f&oe", FL_ALT+'o', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 195                   (void*) some_menu_data);
 196
 197   some_menu_data = new menu_align_data_bundle;
 198   some_menu_data->swm_ptr = this;
 199   some_menu_data->which_align = 4;
 200   choose_align_menu->add("f&um", FL_ALT+'u', (Fl_Callback *) set_align_cb,
 201                   (void*) some_menu_data);
 202 */
 203
 204
 205
 206