elandifier/fctracker/models.py

   1 from django.db import models
   2 from elandifier import settings
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   4 # Create your models here.
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   7 class Specie(models.Model):
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   9   class Admin: pass
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  11   scientific_name = models.CharField(maxlength=256, unique=True, db_index=True)
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  14   def __str__(self):
  15     return self.scientific_name
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  17 #class BedFilePack(models.Model):
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  20
  21 class FlowCell(models.Model):
  22
  23   class Admin: pass
  24
  25   flowcell_id = models.CharField(maxlength=20, unique=True, db_index=True)
  26
  27   run_date = models.DateTimeField()
  28
  29   lane1_sample = models.CharField(maxlength=500)
  30   lane1_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane1_species")
  31   lane2_sample = models.CharField(maxlength=500)
  32   lane2_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane2_species")
  33   lane3_sample = models.CharField(maxlength=500)
  34   lane3_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane3_species")
  35   lane4_sample = models.CharField(maxlength=500)
  36   lane4_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane4_species")
  37
  38   lane5_sample = models.CharField(maxlength=500)
  39   lane5_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane5_species")
  40   lane6_sample = models.CharField(maxlength=500)
  41   lane6_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane6_species")
  42   lane7_sample = models.CharField(maxlength=500)
  43   lane7_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane7_species")
  44   lane8_sample = models.CharField(maxlength=500)
  45   lane8_species = models.ForeignKey(Specie, related_name="lane8_species")
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  47   notes = models.TextField(blank=True)
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  49   def __str__(self):
  50     return self.flowcell_id
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  53 class ElandResult(models.Model):
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  55   class Admin: pass
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  57   flow_cell = models.ForeignKey(FlowCell)
  58   config_file = models.FileField(upload_to=settings.UPLOADTO_CONFIG_FILE)
  59   eland_result_pack = models.FileField(upload_to=settings.UPLOADTO_ELAND_RESULT_PACKS)
  60   bed_file_pack = models.FileField(upload_to=settings.UPLOADTO_BED_PACKS)
  61
  62   notes = models.TextField(blank=True)