encode_submission/annotations.sql

   1 with
   2   annotation as (
   3   select
   4     uri as annotation,
   5     payload->>'description' as description,
   6     jsonb_array_elements_text(payload->'files') as file
   7   from item
   8   where object_type = 'Annotation'
   9   ),
  10   file as (
  11   select
  12     uri as file,
  13     payload->>'status' as status,
  14     payload->>'file_type' as file_type,
  15     payload->>'file_format' as file_format,
  16     payload->>'output_type' as output_type,
  17     payload->>'output_category' as category
  18   from item
  19   where object_type = 'File'
  20   )
  21 select annotation, description, file.file, status, file_type, file_format, category
  22 from annotation
  23      join file on annotation.file = file.file
  24 where category != 'raw data'
  25 ;