encode_submission/biosample.sql

   1 with recursive
   2    biosample(uri, payload, parent_of, part_of, d) as (
   3        select uri, payload,
   4               jsonb_array_elements_text(payload->'parent_of') as parent_of,
   5               payload->>'part_of' as part_of,
   6               1
   7        from item
   8        where object_type = 'Biosample'
   9    union all
  10        select child.uri, child.payload,
  11               jsonb_array_elements_text(child.payload->'parent_of') as parent_of,
  12               child.payload->>'part_of' as part_of,
  13               d + 1
  14        from biosample, item child
  15        where biosample.uri = child.payload->>'part_of'
  16    )
  17 select part_of, uri, parent_of, d
  18 from biosample
  19 where d > 1
  20 order by uri