gaworkflow/frontend/exp_track/models.py

   1 from django.db import models
   2 from datetime import datetime
   3 from gaworkflow.frontend.fctracker.models import Library
   4
   5 class Task(models.Model):
   6   task_name = models.CharField(max_length=50,unique=True, db_index=True)
   7   subject1 = models.ForeignKey(Library,related_name='sbj1_library',verbose_name="Subject")
   8   subject2 = models.ForeignKey(Library,related_name='sbj2_library',verbose_name="Subject 2 / Control",blank=True,null=True)
   9   CALCS = (
  10       ('QuEST', 'QuEST Peak Calling'),
  11       ('WingPeaks', 'Wing Peak Calling'),
  12       ('qPCR', 'In Silico qPCR'),
  13       ('CompareLibs', 'Compare Libaraies'),
  14       ('ComparePeakCalls','Compare Peak Calls'),
  15       ('ProfileReads','Profile Reads')
  16     )
  17   apply_calc = models.CharField(max_length=50,choices=CALCS,verbose_name='Applied Calculation')
  18   ## userid = # logged in user
  19   task_status = models.CharField(max_length=500,blank=True,null=True,default='defined')
  20   results_location = models.CharField(max_length=2000,blank=True,null=True)
  21   submitted_on = models.DateTimeField(core=True,default=datetime.now())
  22   run_note = models.CharField(max_length=500,blank=True,null=True)
  23
  24   def __str__(self):
  25       return '"%s" - %s on [%s]/[%s]' % (self.task_name,self.apply_calc,self.subject1,self.subject2)
  26
  27   def InProjects(self):
  28       return '...'
  29       ps = self.project_set.all()
  30       pstr = 'In '
  31       return pstr
  32       for p in ps:
  33         pstr += '%s, ' % (p.project_name)
  34       return pstr
  35
  36   class Admin:
  37     list_display = ('task_name','apply_calc','subject1','subject2','InProjects','submitted_on','task_status')
  38     list_filter = ('apply_calc',)
  39     fields = (
  40         (None, {
  41           'fields': (('task_name'),('apply_calc'),('subject1'),('subject2'))
  42            }),
  43           ('system fields', {
  44              'classes': 'collapse',
  45            'fields': (('submitted_on'),('task_status','run_note'))
  46           }),
  47         )
  48
  49
  50 class Project(models.Model):
  51     project_name = models.CharField(max_length=50,unique=True, db_index=True)
  52     tasks = models.ManyToManyField(Task,related_name='project_tasks',null=True)
  53     project_notes = models.CharField(max_length=500,blank=True,null=True)
  54
  55     def __str__(self):
  56       return '%s' % (self.project_name)
  57
  58     def ProjectTasks(self):
  59       ptasks = self.tasks.all().order_by('id')
  60       surl = 'data analysis server'
  61       tstr = '<script>'
  62       tstr += 'function togView(eid){'
  63       tstr += 'f=document.getElementById(eid);'
  64       tstr += 'if(f.height==0){'
  65       tstr += 'f.height=400;'
  66       tstr += 'f.style.border=\'solid #cccccc 3px\';'
  67       tstr += '}else{'
  68       tstr += 'f.height=0;'
  69       tstr += 'f.style.border=\'none\';'
  70       tstr += '}'
  71       tstr += '}'
  72       tstr += '</script>'
  73       tstr += '<table><tr><th>Task</th><th>Job Status</th>'
  74       for t in ptasks:
  75         tstr += '<tr><td width=250>%s</td><td>%s</td></tr>'  % (t.task_name,t.task_status)
  76
  77       tstr += '</table>'
  78       tstr += '<div>'
  79       tstr += '<div align=center><a onClick="togView(\'RFrame'+self.id.__str__()+'\');" href="'+surl+self.id.__str__()+'/" title="View Results Page" target="RFrame'+self.id.__str__()+'">VIEW PROJECT RESULTS</a></div>'
  80       tstr += '<iframe width="100%" height="0" frameborder="0" style="background-color:#ffffff" name="RFrame'+self.id.__str__()+'" id="RFrame'+self.id.__str__()+'"/></iframe></div>'
  81
  82       return tstr
  83
  84     ProjectTasks.allow_tags = True
  85
  86     class Admin:
  87       list_display = ('project_name','ProjectTasks')
  88       # list_filter = ('...',)
  89       fields = (
  90         (None, {
  91           'fields': (('project_name'),('tasks'),('project_notes'))}),
  92         )