Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / cdf / nbinomial.c
1 /* cdf/negbinom.c
2  *
3  * Copyright (C) 2004 Jason H. Stover.
4  *
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  *
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  *
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_math.h>
23 #include <gsl/gsl_errno.h>
24 #include <gsl/gsl_cdf.h>
25
26 #include "error.h"
27
28 /*
29  * Pr(X <= k) for a negative binomial random variable X, i.e.,
30  * the probability of k or fewer failuers before success n.
31  */
32
33 double
34 gsl_cdf_negative_binomial_P (const unsigned int k, const double p, const double n)
35 {
36   double P;
37   double a;
38   double b;
39
40   if (p > 1.0 || p < 0.0)
41     {
42       CDF_ERROR ("p < 0 or p > 1", GSL_EDOM);
43     }
44
45   if (n < 0)
46     {
47       CDF_ERROR ("n < 0", GSL_EDOM);
48     }
49
50   a = (double) n;
51   b = (double) k + 1.0;
52   P = gsl_cdf_beta_P (p, a, b);
53
54   return P;
55 }
56
57 /*
58  * Pr ( X > k ).
59  */
60
61 double
62 gsl_cdf_negative_binomial_Q (const unsigned int k, const double p, const double n)
63 {
64   double Q;
65   double a;
66   double b;
67
68   if (p > 1.0 || p < 0.0)
69     {
70       CDF_ERROR ("p < 0 or p > 1", GSL_EDOM);
71     }
72
73   if (n < 0)
74     {
75       CDF_ERROR ("n < 0", GSL_EDOM);
76     }
77
78   a = (double) n;
79   b = (double) k + 1.0;
80   Q = gsl_cdf_beta_Q (p, a, b);
81
82   return Q;
83 }