Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / dht / gsl_dht.h
1 /* dht/gsl_dht.h
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000 Gerard Jungman
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 /* Author:  G. Jungman
21  */
22 #ifndef __GSL_DHT_H__
23 #define __GSL_DHT_H__
24
25 #undef __BEGIN_DECLS
26 #undef __END_DECLS
27 #ifdef __cplusplus
28 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
29 # define __END_DECLS }
30 #else
31 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
32 # define __END_DECLS /* empty */
33 #endif
34
35 __BEGIN_DECLS
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38 struct gsl_dht_struct {
39   size_t    size;  /* size of the sample arrays to be transformed    */
40   double    nu;    /* Bessel function order                          */
41   double    xmax;  /* the upper limit to the x-sampling domain       */
42   double    kmax;  /* the upper limit to the k-sampling domain       */
43   double *  j;     /* array of computed J_nu zeros, j_{nu,s} = j[s]  */
44   double *  Jjj;   /* transform numerator, J_nu(j_i j_m / j_N)       */
45   double *  J2;    /* transform denominator, J_{nu+1}^2(j_m)         */
46 };
47 typedef struct gsl_dht_struct gsl_dht;
48
49
50 /* Create a new transform object for a given size
51  * sampling array on the domain [0, xmax].
52  */
53 gsl_dht * gsl_dht_alloc(size_t size);
54 gsl_dht * gsl_dht_new(size_t size, double nu, double xmax);
55
56 /* Recalculate a transform object for given values of nu, xmax.
57  * You cannot change the size of the object since the internal
58  * allocation is reused.
59  */
60 int gsl_dht_init(gsl_dht * t, double nu, double xmax);
61
62 /* The n'th computed x sample point for a given transform.
63  * 0 <= n <= size-1
64  */
65 double gsl_dht_x_sample(const gsl_dht * t, int n);
66
67
68 /* The n'th computed k sample point for a given transform.
69  * 0 <= n <= size-1
70  */
71 double gsl_dht_k_sample(const gsl_dht * t, int n);
72
73
74 /* Free a transform object.
75  */
76 void gsl_dht_free(gsl_dht * t);
77
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79 /* Perform a transform on a sampled array.
80  * f_in[0] ... f_in[size-1] and similarly for f_out[]
81  */
82 int gsl_dht_apply(const gsl_dht * t, double * f_in, double * f_out);
83
84
85 __END_DECLS
86
87 #endif /* __GSL_DHT_H__ */