htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/doc/examples/fitting2.c

   1 #include <stdio.h>
   2 #include <gsl/gsl_multifit.h>
   3
   4 int
   5 main (int argc, char **argv)
   6 {
   7   int i, n;
   8   double xi, yi, ei, chisq;
   9   gsl_matrix *X, *cov;
  10   gsl_vector *y, *w, *c;
  11
  12   if (argc != 2)
  13     {
  14       fprintf (stderr,"usage: fit n < data\n");
  15       exit (-1);
  16     }
  17
  18   n = atoi (argv[1]);
  19
  20   X = gsl_matrix_alloc (n, 3);
  21   y = gsl_vector_alloc (n);
  22   w = gsl_vector_alloc (n);
  23
  24   c = gsl_vector_alloc (3);
  25   cov = gsl_matrix_alloc (3, 3);
  26
  27   for (i = 0; i < n; i++)
  28     {
  29       int count = fscanf (stdin, "%lg %lg %lg",
  30                           &xi, &yi, &ei);
  31
  32       if (count != 3)
  33         {
  34           fprintf (stderr, "error reading file\n");
  35           exit (-1);
  36         }
  37
  38       printf ("%g %g +/- %g\n", xi, yi, ei);
  39
  40       gsl_matrix_set (X, i, 0, 1.0);
  41       gsl_matrix_set (X, i, 1, xi);
  42       gsl_matrix_set (X, i, 2, xi*xi);
  43
  44       gsl_vector_set (y, i, yi);
  45       gsl_vector_set (w, i, 1.0/(ei*ei));
  46     }
  47
  48   {
  49     gsl_multifit_linear_workspace * work
  50       = gsl_multifit_linear_alloc (n, 3);
  51     gsl_multifit_wlinear (X, w, y, c, cov,
  52                           &chisq, work);
  53     gsl_multifit_linear_free (work);
  54   }
  55
  56 #define C(i) (gsl_vector_get(c,(i)))
  57 #define COV(i,j) (gsl_matrix_get(cov,(i),(j)))
  58
  59   {
  60     printf ("# best fit: Y = %g + %g X + %g X^2\n",
  61             C(0), C(1), C(2));
  62
  63     printf ("# covariance matrix:\n");
  64     printf ("[ %+.5e, %+.5e, %+.5e  \n",
  65                COV(0,0), COV(0,1), COV(0,2));
  66     printf ("  %+.5e, %+.5e, %+.5e  \n",
  67                COV(1,0), COV(1,1), COV(1,2));
  68     printf ("  %+.5e, %+.5e, %+.5e ]\n",
  69                COV(2,0), COV(2,1), COV(2,2));
  70     printf ("# chisq = %g\n", chisq);
  71   }
  72
  73   gsl_matrix_free (X);
  74   gsl_vector_free (y);
  75   gsl_vector_free (w);
  76   gsl_vector_free (c);
  77   gsl_matrix_free (cov);
  78
  79   return 0;
  80 }