Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / fft / hc_radix2.c
1 /* fft/hc_radix2.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 int
21 FUNCTION(gsl_fft_halfcomplex,radix2_backward) (BASE data[],
22                                                const size_t stride,
23                                                const size_t n)
24 {
25   int status = FUNCTION(gsl_fft_halfcomplex,radix2_transform) (data, stride, n) ;
26   return status ;
27 }
28
29 int
30 FUNCTION(gsl_fft_halfcomplex,radix2_inverse) (BASE data[],
31                                               const size_t stride,
32                                               const size_t n)
33 {
34   int status = FUNCTION(gsl_fft_halfcomplex,radix2_transform) (data, stride, n);
35
36   if (status)
37     {
38       return status;
39     }
40
41   /* normalize inverse fft with 1/n */
42
43   {
44     const ATOMIC norm = 1.0 / n;
45     size_t i;
46     for (i = 0; i < n; i++)
47       {
48         data[stride*i] *= norm;
49       }
50   }
51   return status;
52 }
53
54 int
55 FUNCTION(gsl_fft_halfcomplex,radix2_transform) (BASE data[],
56                                                 const size_t stride,
57                                                 const size_t n)
58 {
59   int result ;
60   size_t p, p_1, q;
61   size_t i; 
62   size_t logn = 0;
63   int status;
64
65   if (n == 1) /* identity operation */
66     {
67       return 0 ;
68     }
69
70   /* make sure that n is a power of 2 */
71
72   result = fft_binary_logn(n) ;
73
74   if (result == -1) 
75     {
76       GSL_ERROR ("n is not a power of 2", GSL_EINVAL);
77     } 
78   else 
79     {
80       logn = result ;
81     }
82
83   /* apply fft recursion */
84
85   p = n; q = 1 ; p_1 = n/2 ;
86
87   for (i = 1; i <= logn; i++)
88     {
89       size_t a, b;
90
91       /* a = 0 */
92
93       for (b = 0; b < q; b++)
94         {
95           const ATOMIC z0 = VECTOR(data,stride,b*p);
96           const ATOMIC z1 = VECTOR(data,stride,b*p + p_1);
97           
98           const ATOMIC t0_real = z0 + z1 ;
99           const ATOMIC t1_real = z0 - z1 ;
100           
101           VECTOR(data,stride,b*p) = t0_real;
102           VECTOR(data,stride,b*p + p_1) = t1_real ;
103         }
104
105       /* a = 1 ... p_{i-1}/2 - 1 */
106
107       {
108         ATOMIC w_real = 1.0;
109         ATOMIC w_imag = 0.0;
110
111         const ATOMIC theta = 2.0 * M_PI / p;
112         
113         const ATOMIC s = sin (theta);
114         const ATOMIC t = sin (theta / 2.0);
115         const ATOMIC s2 = 2.0 * t * t;
116         
117         for (a = 1; a < (p_1)/2; a++)
118           {
119             /* trignometric recurrence for w-> exp(i theta) w */
120             
121             {
122               const ATOMIC tmp_real = w_real - s * w_imag - s2 * w_real;
123               const ATOMIC tmp_imag = w_imag + s * w_real - s2 * w_imag;
124               w_real = tmp_real;
125               w_imag = tmp_imag;
126             }
127             
128             for (b = 0; b < q; b++)
129               {
130                 ATOMIC z0_real = VECTOR(data,stride,b*p + a) ;
131                 ATOMIC z0_imag = VECTOR(data,stride,b*p + p - a) ;
132                 ATOMIC z1_real = VECTOR(data,stride,b*p + p_1 - a) ;
133                 ATOMIC z1_imag = -VECTOR(data,stride,b*p + p_1 + a) ;
134                 
135                 /* t0 = z0 + z1 */
136                 
137                 ATOMIC t0_real = z0_real + z1_real;
138                 ATOMIC t0_imag = z0_imag + z1_imag;
139                 
140                 /* t1 = (z0 - z1) */
141                 
142                 ATOMIC t1_real = z0_real -  z1_real;
143                 ATOMIC t1_imag = z0_imag -  z1_imag;
144                 
145                 VECTOR(data,stride,b*p + a) = t0_real ;
146                 VECTOR(data,stride,b*p + p_1 - a) = t0_imag ;
147                 
148                 VECTOR(data,stride,b*p + p_1 + a) = (w_real * t1_real - w_imag * t1_imag) ;
149                 VECTOR(data,stride,b*p + p - a) = (w_real * t1_imag + w_imag * t1_real) ;
150               }
151           }
152       }
153
154       if (p_1 >  1) {
155         for (b = 0; b < q; b++) {
156           VECTOR(data,stride,b*p + p_1/2) *= 2 ;
157           VECTOR(data,stride,b*p + p_1 + p_1/2) *= -2 ;
158         }
159       }
160
161       p_1 = p_1 / 2 ;
162       p = p / 2 ;
163       q = q * 2 ;
164     }
165
166   /* bit reverse the ordering of output data for decimation in
167      frequency algorithm */
168   
169   status = FUNCTION(fft_real,bitreverse_order)(data, stride, n, logn) ;
170
171   return 0;
172
173 }