Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / integration / qmomo.c
1 /* integration/qmomo.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <stdlib.h>
22 #include <gsl/gsl_integration.h>
23 #include <gsl/gsl_errno.h>
24
25 static void
26 initialise (double * ri, double * rj, double * rg, double * rh,
27             double alpha, double beta);
28
29 gsl_integration_qaws_table * 
30 gsl_integration_qaws_table_alloc (double alpha, double beta, int mu, int nu)
31 {
32   gsl_integration_qaws_table * t;
33
34   if (alpha < -1.0)
35     {
36       GSL_ERROR_VAL ("alpha must be greater than -1.0", GSL_EINVAL, 0);
37     }
38
39   if (beta < -1.0)
40     {
41       GSL_ERROR_VAL ("beta must be greater than -1.0", GSL_EINVAL, 0);
42     }
43
44   if (mu != 0 && mu != 1)
45     {
46       GSL_ERROR_VAL ("mu must be 0 or 1", GSL_EINVAL, 0);
47     }
48
49   if (nu != 0 && nu != 1)
50     {
51       GSL_ERROR_VAL ("nu must be 0 or 1", GSL_EINVAL, 0);
52     }
53
54   t = (gsl_integration_qaws_table *) 
55     malloc(sizeof(gsl_integration_qaws_table));
56
57   if (t == 0)
58     {
59       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for qaws_table struct",
60                         GSL_ENOMEM, 0);
61     }
62
63   t->alpha = alpha;
64   t->beta = beta;
65   t->mu = mu;
66   t->nu = nu;
67   
68   initialise (t->ri, t->rj, t->rg, t->rh, alpha, beta);
69   
70   return t;
71 }
72
73
74 int
75 gsl_integration_qaws_table_set (gsl_integration_qaws_table * t,
76                                 double alpha, double beta, int mu, int nu)
77 {
78   if (alpha < -1.0)
79     {
80       GSL_ERROR ("alpha must be greater than -1.0", GSL_EINVAL);
81     }
82
83   if (beta < -1.0)
84     {
85       GSL_ERROR ("beta must be greater than -1.0", GSL_EINVAL);
86     }
87
88   if (mu != 0 && mu != 1)
89     {
90       GSL_ERROR ("mu must be 0 or 1", GSL_EINVAL);
91     }
92
93   if (nu != 0 && nu != 1)
94     {
95       GSL_ERROR ("nu must be 0 or 1", GSL_EINVAL);
96     }
97
98   t->alpha = alpha;
99   t->beta = beta;
100   t->mu = mu;
101   t->nu = nu;
102   
103   initialise (t->ri, t->rj, t->rg, t->rh, alpha, beta);
104
105   return GSL_SUCCESS;
106 }
107
108
109 void
110 gsl_integration_qaws_table_free (gsl_integration_qaws_table * t)
111 {
112   free (t);
113 }
114
115 static void
116 initialise (double * ri, double * rj, double * rg, double * rh,
117             double alpha, double beta)
118 {
119   const double alpha_p1 = alpha + 1.0;
120   const double beta_p1 = beta + 1.0;
121
122   const double alpha_p2 = alpha + 2.0;
123   const double beta_p2 = beta + 2.0;
124
125   const double r_alpha = pow (2.0, alpha_p1);
126   const double r_beta = pow (2.0, beta_p1);
127
128   size_t i;
129   
130   double an, anm1;
131
132   ri[0] = r_alpha / alpha_p1;
133   ri[1] = ri[0] * alpha / alpha_p2;
134
135   an = 2.0;
136   anm1 = 1.0;
137
138   for (i = 2; i < 25; i++)
139     {
140       ri[i] = -(r_alpha + an * (an - alpha_p2) * ri[i - 1])
141         / (anm1 * (an + alpha_p1));
142       anm1 = an;
143       an = an + 1.0;
144     }
145
146   rj[0] = r_beta / beta_p1;
147   rj[1] = rj[0] * beta / beta_p2;
148
149   an = 2.0;
150   anm1 = 1.0;
151
152   for (i = 2; i < 25; i++)
153     {
154       rj[i] = -(r_beta + an * (an - beta_p2) * rj[i - 1])
155         / (anm1 * (an + beta_p1));
156       anm1 = an;
157       an = an + 1.0;
158     }
159
160   rg[0] = -ri[0] / alpha_p1;
161   rg[1] = -rg[0] - 2.0 * r_alpha / (alpha_p2 * alpha_p2);
162
163   an = 2.0;
164   anm1 = 1.0;
165
166   for (i = 2; i < 25; i++)
167     {
168       rg[i] = -(an * (an - alpha_p2) * rg[i - 1] - an * ri[i - 1]
169                 + anm1 * ri[i]) / (anm1 * (an + alpha_p1));
170       anm1 = an;
171       an = an + 1.0;
172     }
173
174   rh[0] = -rj[0] / beta_p1;
175   rh[1] = -rh[0] - 2.0 * r_beta / (beta_p2 * beta_p2);
176
177   an = 2.0;
178   anm1 = 1.0;
179
180   for (i = 2; i < 25; i++)
181     {
182       rh[i] = -(an * (an - beta_p2) * rh[i - 1] - an * rj[i - 1]
183                 + anm1 * rj[i]) / (anm1 * (an + beta_p1));
184       anm1 = an;
185       an = an + 1.0;
186     }
187
188   for (i = 1; i < 25; i += 2)
189     {
190       rj[i] *= -1;
191       rh[i] *= -1;
192     }
193 }