Added MACS source
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / linalg / apply_givens.c
1 /* linalg/apply_givens.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001, 2007 Gerard Jungman, Brian Gough
4  * Copyright (C) 2004 Joerg Wensch, modifications for LQ.
5  * 
6  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
7  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
8  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
9  * your option) any later version.
10  * 
11  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
13  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
14  * General Public License for more details.
15  * 
16  * You should have received a copy of the GNU General Public License
17  * along with this program; if not, write to the Free Software
18  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
19  */
20
21 inline static void
22 apply_givens_qr (size_t M, size_t N, gsl_matrix * Q, gsl_matrix * R,
23                  size_t i, size_t j, double c, double s)
24 {
25   size_t k;
26
27   /* Apply rotation to matrix Q,  Q' = Q G */
28
29 #if USE_BLAS
30   {
31     gsl_matrix_view Q0M = gsl_matrix_submatrix(Q,0,0,M,j+1);
32     gsl_vector_view Qi = gsl_matrix_column(&Q0M.matrix,i);
33     gsl_vector_view Qj = gsl_matrix_column(&Q0M.matrix,j);
34     gsl_blas_drot(&Qi.vector, &Qj.vector, c, -s);
35   }
36 #else
37   for (k = 0; k < M; k++)
38     {
39       double qki = gsl_matrix_get (Q, k, i);
40       double qkj = gsl_matrix_get (Q, k, j);
41       gsl_matrix_set (Q, k, i, qki * c - qkj * s);
42       gsl_matrix_set (Q, k, j, qki * s + qkj * c);
43     }
44 #endif
45
46   /* Apply rotation to matrix R, R' = G^T R (note: upper triangular so
47      zero for column < row) */
48
49 #if USE_BLAS
50   {
51     k = GSL_MIN(i,j);
52     gsl_matrix_view R0 = gsl_matrix_submatrix(R, 0, k, j+1, N-k);
53     gsl_vector_view Ri = gsl_matrix_row(&R0.matrix,i);
54     gsl_vector_view Rj = gsl_matrix_row(&R0.matrix,j);
55     gsl_blas_drot(&Ri.vector, &Rj.vector, c, -s);
56   }
57 #else
58   for (k = GSL_MIN (i, j); k < N; k++)
59     {
60       double rik = gsl_matrix_get (R, i, k);
61       double rjk = gsl_matrix_get (R, j, k);
62       gsl_matrix_set (R, i, k, c * rik - s * rjk);
63       gsl_matrix_set (R, j, k, s * rik + c * rjk);
64     }
65 #endif
66 }
67
68 inline static void
69 apply_givens_lq (size_t M, size_t N, gsl_matrix * Q, gsl_matrix * L,
70                  size_t i, size_t j, double c, double s)
71 {
72   size_t k;
73
74   /* Apply rotation to matrix Q,  Q' = G Q */
75
76 #if USE_BLAS
77   {
78     gsl_matrix_view Q0M = gsl_matrix_submatrix(Q,0,0,j+1,M);
79     gsl_vector_view Qi = gsl_matrix_row(&Q0M.matrix,i);
80     gsl_vector_view Qj = gsl_matrix_row(&Q0M.matrix,j);
81     gsl_blas_drot(&Qi.vector, &Qj.vector, c, -s);
82   }
83 #else
84   for (k = 0; k < M; k++)
85     {
86       double qik = gsl_matrix_get (Q, i, k);
87       double qjk = gsl_matrix_get (Q, j, k);
88       gsl_matrix_set (Q, i, k, qik * c - qjk * s);
89       gsl_matrix_set (Q, j, k, qik * s + qjk * c);
90     }
91 #endif
92
93   /* Apply rotation to matrix L, L' = L G^T (note: lower triangular so
94      zero for column > row) */
95
96 #if USE_BLAS
97   {
98     k = GSL_MIN(i,j);
99     gsl_matrix_view L0 = gsl_matrix_submatrix(L, k, 0, N-k, j+1);
100     gsl_vector_view Li = gsl_matrix_column(&L0.matrix,i);
101     gsl_vector_view Lj = gsl_matrix_column(&L0.matrix,j);
102     gsl_blas_drot(&Li.vector, &Lj.vector, c, -s);
103   }
104 #else
105   for (k = GSL_MIN (i, j); k < N; k++)
106     {
107       double lki = gsl_matrix_get (L, k, i);
108       double lkj = gsl_matrix_get (L, k, j);
109       gsl_matrix_set (L, k, i, c * lki - s * lkj);
110       gsl_matrix_set (L, k, j, s * lki + c * lkj);
111     }
112 #endif
113 }
114
115 inline static void
116 apply_givens_vec (gsl_vector * v, size_t i, size_t j, double c, double s)
117 {
118   /* Apply rotation to vector v' = G^T v */
119
120   double vi = gsl_vector_get (v, i);
121   double vj = gsl_vector_get (v, j);
122   gsl_vector_set (v, i, c * vi - s * vj);
123   gsl_vector_set (v, j, s * vi + c * vj);
124 }
125