Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / linalg / householdercomplex.c
1 /* linalg/householdercomplex.c
2  * 
3  * Copyright (C) 2001, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 /* Computes a householder transformation matrix H such that
21  *
22  *       H' v = -/+ |v| e_1
23  *
24  * where e_1 is the first unit vector.  On exit the matrix H can be
25  * computed from the return values (tau, v)
26  *
27  *       H = I - tau * w * w'
28  *
29  * where w = (1, v(2), ..., v(N)). The nonzero element of the result
30  * vector -/+|v| e_1 is stored in v(1).
31  *
32  * Note that the matrix H' in the householder transformation is the
33  * hermitian conjugate of H.  To compute H'v, pass the conjugate of
34  * tau as the first argument to gsl_linalg_householder_hm() rather
35  * than tau itself. See the LAPACK function CLARFG for details of this
36  * convention.  */
37
38 #include <config.h>
39 #include <stdlib.h>
40 #include <gsl/gsl_math.h>
41 #include <gsl/gsl_vector.h>
42 #include <gsl/gsl_matrix.h>
43 #include <gsl/gsl_blas.h>
44 #include <gsl/gsl_complex_math.h>
45
46 #include <gsl/gsl_linalg.h>
47
48 gsl_complex
49 gsl_linalg_complex_householder_transform (gsl_vector_complex * v)
50 {
51   /* replace v[0:n-1] with a householder vector (v[0:n-1]) and
52      coefficient tau that annihilate v[1:n-1] */
53
54   const size_t n = v->size ;
55   
56   if (n == 1)
57     {
58       gsl_complex alpha = gsl_vector_complex_get (v, 0) ;      
59       double absa = gsl_complex_abs (alpha);
60       double beta_r = - (GSL_REAL(alpha) >= 0 ? +1 : -1) * absa ;
61
62       gsl_complex tau;
63
64       if (beta_r == 0.0)
65         {
66           GSL_REAL(tau) = 0.0;
67           GSL_IMAG(tau) = 0.0;
68         }
69       else 
70         {
71           GSL_REAL(tau) = (beta_r - GSL_REAL(alpha)) / beta_r ;
72           GSL_IMAG(tau) = - GSL_IMAG(alpha) / beta_r ;
73
74           {
75             gsl_complex beta = gsl_complex_rect (beta_r, 0.0);
76             gsl_vector_complex_set (v, 0, beta) ;
77           }
78         }
79       
80       return tau;
81     }
82   else
83     { 
84       gsl_complex tau ;
85       double beta_r;
86
87       gsl_vector_complex_view x = gsl_vector_complex_subvector (v, 1, n - 1) ; 
88       gsl_complex alpha = gsl_vector_complex_get (v, 0) ;            
89       double absa = gsl_complex_abs (alpha);
90       double xnorm = gsl_blas_dznrm2 (&x.vector);
91       
92       if (xnorm == 0 && GSL_IMAG(alpha) == 0) 
93         {
94           gsl_complex zero = gsl_complex_rect(0.0, 0.0);
95           return zero; /* tau = 0 */
96         }
97       
98       beta_r = - (GSL_REAL(alpha) >= 0 ? +1 : -1) * hypot(absa, xnorm) ;
99
100       GSL_REAL(tau) = (beta_r - GSL_REAL(alpha)) / beta_r ;
101       GSL_IMAG(tau) = - GSL_IMAG(alpha) / beta_r ;
102
103       {
104         gsl_complex amb = gsl_complex_sub_real(alpha, beta_r);
105         gsl_complex s = gsl_complex_inverse(amb);
106         gsl_blas_zscal (s, &x.vector);
107       }
108       
109       {
110         gsl_complex beta = gsl_complex_rect (beta_r, 0.0);
111         gsl_vector_complex_set (v, 0, beta) ;
112       }
113       
114       return tau;
115     }
116 }
117
118 int
119 gsl_linalg_complex_householder_hm (gsl_complex tau, const gsl_vector_complex * v, gsl_matrix_complex * A)
120 {
121   /* applies a householder transformation v,tau to matrix m */
122
123   size_t i, j;
124
125   if (GSL_REAL(tau) == 0.0 && GSL_IMAG(tau) == 0.0)
126     {
127       return GSL_SUCCESS;
128     }
129
130   /* w = (v' A)^T */
131
132   for (j = 0; j < A->size2; j++)
133     {
134       gsl_complex tauwj;
135       gsl_complex wj = gsl_matrix_complex_get(A,0,j);  
136
137       for (i = 1; i < A->size1; i++)  /* note, computed for v(0) = 1 above */
138         {
139           gsl_complex Aij = gsl_matrix_complex_get(A,i,j);
140           gsl_complex vi = gsl_vector_complex_get(v,i);
141           gsl_complex Av = gsl_complex_mul (Aij, gsl_complex_conjugate(vi));
142           wj = gsl_complex_add (wj, Av);
143         }
144
145       tauwj = gsl_complex_mul (tau, wj);
146
147       /* A = A - v w^T */
148       
149       {
150         gsl_complex A0j = gsl_matrix_complex_get (A, 0, j);
151         gsl_complex Atw = gsl_complex_sub (A0j, tauwj);
152         /* store A0j - tau  * wj */
153         gsl_matrix_complex_set (A, 0, j, Atw);
154       }
155       
156       for (i = 1; i < A->size1; i++)
157         {
158           gsl_complex vi = gsl_vector_complex_get (v, i);
159           gsl_complex tauvw = gsl_complex_mul(vi, tauwj);
160           gsl_complex Aij = gsl_matrix_complex_get (A, i, j);
161           gsl_complex Atwv = gsl_complex_sub (Aij, tauvw);
162           /* store Aij - tau * vi * wj */
163           gsl_matrix_complex_set (A, i, j, Atwv);
164         }
165     }
166       
167   return GSL_SUCCESS;
168 }
169
170 int
171 gsl_linalg_complex_householder_mh (gsl_complex tau, const gsl_vector_complex * v, gsl_matrix_complex * A)
172 {
173   /* applies a householder transformation v,tau to matrix m on the right */
174
175   size_t i, j;
176
177   if (GSL_REAL(tau) == 0.0 && GSL_IMAG(tau) == 0.0)
178     {
179       return GSL_SUCCESS;
180     }
181
182   /* A -> A - A*tau*v*v^h */
183
184   for (i = 0; i < A->size1; i++)
185     {
186       gsl_complex tauwi;
187       gsl_complex Ai0 = gsl_matrix_complex_get (A, i, 0);
188       gsl_complex wi = Ai0;
189
190       /* compute w = A v */
191       for (j = 1; j < A->size2; j++)  /* note, computed for v(0) = 1 above */
192         {
193           gsl_complex Aij = gsl_matrix_complex_get(A, i, j);
194           gsl_complex vj = gsl_vector_complex_get(v, j);
195           gsl_complex Av = gsl_complex_mul (Aij, vj);
196           wi = gsl_complex_add (wi, Av);
197         }
198
199       tauwi = gsl_complex_mul (tau, wi);
200
201       /* A = A - w v^H */
202       
203       {
204         gsl_complex Atw = gsl_complex_sub (Ai0, tauwi);
205         /* store Ai0 - tau  * wi */
206         gsl_matrix_complex_set (A, i, 0, Atw);
207       }
208       
209       for (j = 1; j < A->size2; j++)
210         {
211           gsl_complex vj = gsl_vector_complex_get (v, j);
212           gsl_complex tauwv = gsl_complex_mul(gsl_complex_conjugate(vj), tauwi);
213           gsl_complex Aij = gsl_matrix_complex_get (A, i, j);
214           gsl_complex Atwv = gsl_complex_sub (Aij, tauwv);
215           /* store Aij - tau * wi * conj(vj) */
216           gsl_matrix_complex_set (A, i, j, Atwv);
217         }
218     }
219       
220   return GSL_SUCCESS;
221 }
222
223 int
224 gsl_linalg_complex_householder_hv (gsl_complex tau, const gsl_vector_complex * v, gsl_vector_complex *  w)
225 {
226   const size_t N = v->size;
227
228   if (GSL_REAL(tau) == 0.0 && GSL_IMAG(tau) == 0.0)
229       return GSL_SUCCESS;
230
231   {
232     /* compute z = v'w */
233
234     gsl_complex z0 = gsl_vector_complex_get(w,0);
235     gsl_complex z1, z;
236     gsl_complex tz, ntz;
237     
238     gsl_vector_complex_const_view v1 = gsl_vector_complex_const_subvector(v, 1, N-1);
239     gsl_vector_complex_view w1 = gsl_vector_complex_subvector(w, 1, N-1);
240
241     gsl_blas_zdotc(&v1.vector, &w1.vector, &z1);
242     
243     z = gsl_complex_add (z0, z1);
244
245     tz = gsl_complex_mul(tau, z);
246     ntz = gsl_complex_negative (tz);
247
248     /* compute w = w - tau * (v'w) * v   */
249
250     {
251       gsl_complex w0 = gsl_vector_complex_get(w, 0);
252       gsl_complex w0ntz = gsl_complex_add (w0, ntz);
253       gsl_vector_complex_set (w, 0, w0ntz);
254     }
255
256     gsl_blas_zaxpy(ntz, &v1.vector, &w1.vector);
257   }
258
259   return GSL_SUCCESS;
260 }