Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / matrix / gsl_matrix_complex_long_double.h
1 /* matrix/gsl_matrix_complex_long_double.h
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Gerard Jungman, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #ifndef __GSL_MATRIX_COMPLEX_LONG_DOUBLE_H__
21 #define __GSL_MATRIX_COMPLEX_LONG_DOUBLE_H__
22
23 #include <stdlib.h>
24 #include <gsl/gsl_types.h>
25 #include <gsl/gsl_errno.h>
26 #include <gsl/gsl_complex.h>
27 #include <gsl/gsl_check_range.h>
28 #include <gsl/gsl_vector_complex_long_double.h>
29
30 #undef __BEGIN_DECLS
31 #undef __END_DECLS
32 #ifdef __cplusplus
33 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
34 # define __END_DECLS }
35 #else
36 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
37 # define __END_DECLS /* empty */
38 #endif
39
40 __BEGIN_DECLS
41
42 typedef struct 
43 {
44   size_t size1;
45   size_t size2;
46   size_t tda;
47   long double * data;
48   gsl_block_complex_long_double * block;
49   int owner;
50 } gsl_matrix_complex_long_double ;
51
52 typedef struct
53 {
54   gsl_matrix_complex_long_double matrix;
55 } _gsl_matrix_complex_long_double_view;
56
57 typedef _gsl_matrix_complex_long_double_view gsl_matrix_complex_long_double_view;
58
59 typedef struct
60 {
61   gsl_matrix_complex_long_double matrix;
62 } _gsl_matrix_complex_long_double_const_view;
63
64 typedef const _gsl_matrix_complex_long_double_const_view gsl_matrix_complex_long_double_const_view;
65
66
67 /* Allocation */
68
69 gsl_matrix_complex_long_double * 
70 gsl_matrix_complex_long_double_alloc (const size_t n1, const size_t n2);
71
72 gsl_matrix_complex_long_double * 
73 gsl_matrix_complex_long_double_calloc (const size_t n1, const size_t n2);
74
75 gsl_matrix_complex_long_double * 
76 gsl_matrix_complex_long_double_alloc_from_block (gsl_block_complex_long_double * b, 
77                                            const size_t offset, 
78                                            const size_t n1, const size_t n2, const size_t d2);
79
80 gsl_matrix_complex_long_double * 
81 gsl_matrix_complex_long_double_alloc_from_matrix (gsl_matrix_complex_long_double * b,
82                                             const size_t k1, const size_t k2,
83                                             const size_t n1, const size_t n2);
84
85 gsl_vector_complex_long_double * 
86 gsl_vector_complex_long_double_alloc_row_from_matrix (gsl_matrix_complex_long_double * m,
87                                                 const size_t i);
88
89 gsl_vector_complex_long_double * 
90 gsl_vector_complex_long_double_alloc_col_from_matrix (gsl_matrix_complex_long_double * m,
91                                                 const size_t j);
92
93 void gsl_matrix_complex_long_double_free (gsl_matrix_complex_long_double * m);
94
95 /* Views */
96
97 _gsl_matrix_complex_long_double_view 
98 gsl_matrix_complex_long_double_submatrix (gsl_matrix_complex_long_double * m, 
99                             const size_t i, const size_t j, 
100                             const size_t n1, const size_t n2);
101
102 _gsl_vector_complex_long_double_view 
103 gsl_matrix_complex_long_double_row (gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i);
104
105 _gsl_vector_complex_long_double_view 
106 gsl_matrix_complex_long_double_column (gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t j);
107
108 _gsl_vector_complex_long_double_view 
109 gsl_matrix_complex_long_double_diagonal (gsl_matrix_complex_long_double * m);
110
111 _gsl_vector_complex_long_double_view 
112 gsl_matrix_complex_long_double_subdiagonal (gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t k);
113
114 _gsl_vector_complex_long_double_view 
115 gsl_matrix_complex_long_double_superdiagonal (gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t k);
116
117 _gsl_vector_complex_long_double_view
118 gsl_matrix_complex_long_double_subrow (gsl_matrix_complex_long_double * m,
119                                  const size_t i, const size_t offset,
120                                  const size_t n);
121
122 _gsl_vector_complex_long_double_view
123 gsl_matrix_complex_long_double_subcolumn (gsl_matrix_complex_long_double * m,
124                                     const size_t j, const size_t offset,
125                                     const size_t n);
126
127 _gsl_matrix_complex_long_double_view
128 gsl_matrix_complex_long_double_view_array (long double * base,
129                              const size_t n1, 
130                              const size_t n2);
131
132 _gsl_matrix_complex_long_double_view
133 gsl_matrix_complex_long_double_view_array_with_tda (long double * base, 
134                                       const size_t n1, 
135                                       const size_t n2,
136                                       const size_t tda);
137
138 _gsl_matrix_complex_long_double_view
139 gsl_matrix_complex_long_double_view_vector (gsl_vector_complex_long_double * v,
140                               const size_t n1, 
141                               const size_t n2);
142
143 _gsl_matrix_complex_long_double_view
144 gsl_matrix_complex_long_double_view_vector_with_tda (gsl_vector_complex_long_double * v,
145                                        const size_t n1, 
146                                        const size_t n2,
147                                        const size_t tda);
148
149
150 _gsl_matrix_complex_long_double_const_view 
151 gsl_matrix_complex_long_double_const_submatrix (const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
152                                   const size_t i, const size_t j, 
153                                   const size_t n1, const size_t n2);
154
155 _gsl_vector_complex_long_double_const_view 
156 gsl_matrix_complex_long_double_const_row (const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
157                             const size_t i);
158
159 _gsl_vector_complex_long_double_const_view 
160 gsl_matrix_complex_long_double_const_column (const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
161                                const size_t j);
162
163 _gsl_vector_complex_long_double_const_view
164 gsl_matrix_complex_long_double_const_diagonal (const gsl_matrix_complex_long_double * m);
165
166 _gsl_vector_complex_long_double_const_view 
167 gsl_matrix_complex_long_double_const_subdiagonal (const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
168                                     const size_t k);
169
170 _gsl_vector_complex_long_double_const_view 
171 gsl_matrix_complex_long_double_const_superdiagonal (const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
172                                       const size_t k);
173
174 _gsl_vector_complex_long_double_const_view
175 gsl_matrix_complex_long_double_const_subrow (const gsl_matrix_complex_long_double * m,
176                                        const size_t i, const size_t offset,
177                                        const size_t n);
178
179 _gsl_vector_complex_long_double_const_view
180 gsl_matrix_complex_long_double_const_subcolumn (const gsl_matrix_complex_long_double * m,
181                                           const size_t j, const size_t offset,
182                                           const size_t n);
183
184 _gsl_matrix_complex_long_double_const_view
185 gsl_matrix_complex_long_double_const_view_array (const long double * base,
186                                    const size_t n1, 
187                                    const size_t n2);
188
189 _gsl_matrix_complex_long_double_const_view
190 gsl_matrix_complex_long_double_const_view_array_with_tda (const long double * base, 
191                                             const size_t n1, 
192                                             const size_t n2,
193                                             const size_t tda);
194
195 _gsl_matrix_complex_long_double_const_view
196 gsl_matrix_complex_long_double_const_view_vector (const gsl_vector_complex_long_double * v,
197                                     const size_t n1, 
198                                     const size_t n2);
199
200 _gsl_matrix_complex_long_double_const_view
201 gsl_matrix_complex_long_double_const_view_vector_with_tda (const gsl_vector_complex_long_double * v,
202                                              const size_t n1, 
203                                              const size_t n2,
204                                              const size_t tda);
205
206 /* Operations */
207
208 gsl_complex_long_double gsl_matrix_complex_long_double_get(const gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j);
209 void gsl_matrix_complex_long_double_set(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j, const gsl_complex_long_double x);
210
211 gsl_complex_long_double * gsl_matrix_complex_long_double_ptr(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j);
212 const gsl_complex_long_double * gsl_matrix_complex_long_double_const_ptr(const gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j);
213
214 void gsl_matrix_complex_long_double_set_zero (gsl_matrix_complex_long_double * m);
215 void gsl_matrix_complex_long_double_set_identity (gsl_matrix_complex_long_double * m);
216 void gsl_matrix_complex_long_double_set_all (gsl_matrix_complex_long_double * m, gsl_complex_long_double x);
217
218 int gsl_matrix_complex_long_double_fread (FILE * stream, gsl_matrix_complex_long_double * m) ;
219 int gsl_matrix_complex_long_double_fwrite (FILE * stream, const gsl_matrix_complex_long_double * m) ;
220 int gsl_matrix_complex_long_double_fscanf (FILE * stream, gsl_matrix_complex_long_double * m);
221 int gsl_matrix_complex_long_double_fprintf (FILE * stream, const gsl_matrix_complex_long_double * m, const char * format);
222
223 int gsl_matrix_complex_long_double_memcpy(gsl_matrix_complex_long_double * dest, const gsl_matrix_complex_long_double * src);
224 int gsl_matrix_complex_long_double_swap(gsl_matrix_complex_long_double * m1, gsl_matrix_complex_long_double * m2);
225
226 int gsl_matrix_complex_long_double_swap_rows(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j);
227 int gsl_matrix_complex_long_double_swap_columns(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j);
228 int gsl_matrix_complex_long_double_swap_rowcol(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const size_t j);
229
230 int gsl_matrix_complex_long_double_transpose (gsl_matrix_complex_long_double * m);
231 int gsl_matrix_complex_long_double_transpose_memcpy (gsl_matrix_complex_long_double * dest, const gsl_matrix_complex_long_double * src);
232
233 int gsl_matrix_complex_long_double_isnull (const gsl_matrix_complex_long_double * m);
234 int gsl_matrix_complex_long_double_ispos (const gsl_matrix_complex_long_double * m);
235 int gsl_matrix_complex_long_double_isneg (const gsl_matrix_complex_long_double * m);
236
237 int gsl_matrix_complex_long_double_add (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_matrix_complex_long_double * b);
238 int gsl_matrix_complex_long_double_sub (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_matrix_complex_long_double * b);
239 int gsl_matrix_complex_long_double_mul_elements (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_matrix_complex_long_double * b);
240 int gsl_matrix_complex_long_double_div_elements (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_matrix_complex_long_double * b);
241 int gsl_matrix_complex_long_double_scale (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_complex_long_double x);
242 int gsl_matrix_complex_long_double_add_constant (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_complex_long_double x);
243 int gsl_matrix_complex_long_double_add_diagonal (gsl_matrix_complex_long_double * a, const gsl_complex_long_double x);
244
245 /***********************************************************************/
246 /* The functions below are obsolete                                    */
247 /***********************************************************************/
248 int gsl_matrix_complex_long_double_get_row(gsl_vector_complex_long_double * v, const gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i);
249 int gsl_matrix_complex_long_double_get_col(gsl_vector_complex_long_double * v, const gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t j);
250 int gsl_matrix_complex_long_double_set_row(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t i, const gsl_vector_complex_long_double * v);
251 int gsl_matrix_complex_long_double_set_col(gsl_matrix_complex_long_double * m, const size_t j, const gsl_vector_complex_long_double * v);
252
253 #ifdef HAVE_INLINE
254
255 extern inline 
256 gsl_complex_long_double
257 gsl_matrix_complex_long_double_get(const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
258                      const size_t i, const size_t j)
259 {
260 #if GSL_RANGE_CHECK
261   gsl_complex_long_double zero = {{0,0}};
262
263   if (i >= m->size1)
264     {
265       GSL_ERROR_VAL("first index out of range", GSL_EINVAL, zero) ;
266     }
267   else if (j >= m->size2)
268     {
269       GSL_ERROR_VAL("second index out of range", GSL_EINVAL, zero) ;
270     }
271 #endif
272   return *(gsl_complex_long_double *)(m->data + 2*(i * m->tda + j)) ;
273
274
275 extern inline 
276 void
277 gsl_matrix_complex_long_double_set(gsl_matrix_complex_long_double * m, 
278                      const size_t i, const size_t j, const gsl_complex_long_double x)
279 {
280 #if GSL_RANGE_CHECK
281   if (i >= m->size1)
282     {
283       GSL_ERROR_VOID("first index out of range", GSL_EINVAL) ;
284     }
285   else if (j >= m->size2)
286     {
287       GSL_ERROR_VOID("second index out of range", GSL_EINVAL) ;
288     }
289 #endif
290   *(gsl_complex_long_double *)(m->data + 2*(i * m->tda + j)) = x ;
291 }
292
293 extern inline 
294 gsl_complex_long_double *
295 gsl_matrix_complex_long_double_ptr(gsl_matrix_complex_long_double * m, 
296                              const size_t i, const size_t j)
297 {
298 #if GSL_RANGE_CHECK
299   if (i >= m->size1)
300     {
301       GSL_ERROR_NULL("first index out of range", GSL_EINVAL) ;
302     }
303   else if (j >= m->size2)
304     {
305       GSL_ERROR_NULL("second index out of range", GSL_EINVAL) ;
306     }
307 #endif
308   return (gsl_complex_long_double *)(m->data + 2*(i * m->tda + j)) ;
309
310
311 extern inline 
312 const gsl_complex_long_double *
313 gsl_matrix_complex_long_double_const_ptr(const gsl_matrix_complex_long_double * m, 
314                                    const size_t i, const size_t j)
315 {
316 #if GSL_RANGE_CHECK
317   if (i >= m->size1)
318     {
319       GSL_ERROR_NULL("first index out of range", GSL_EINVAL) ;
320     }
321   else if (j >= m->size2)
322     {
323       GSL_ERROR_NULL("second index out of range", GSL_EINVAL) ;
324     }
325 #endif
326   return (const gsl_complex_long_double *)(m->data + 2*(i * m->tda + j)) ;
327
328
329 #endif /* HAVE_INLINE */
330
331 __END_DECLS
332
333 #endif /* __GSL_MATRIX_COMPLEX_LONG_DOUBLE_H__ */