Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / min / gsl_min.h
1 /* min/gsl_min.h
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #ifndef __GSL_MIN_H__
21 #define __GSL_MIN_H__
22
23 #include <stdlib.h>
24 #include <gsl/gsl_types.h>
25 #include <gsl/gsl_math.h>
26
27 #undef __BEGIN_DECLS
28 #undef __END_DECLS
29 #ifdef __cplusplus
30 # define __BEGIN_DECLS extern "C" {
31 # define __END_DECLS }
32 #else
33 # define __BEGIN_DECLS /* empty */
34 # define __END_DECLS /* empty */
35 #endif
36
37 __BEGIN_DECLS
38
39 typedef struct
40   {
41     const char *name;
42     size_t size;
43     int (*set) (void *state, gsl_function * f, double x_minimum, double f_minimum, double x_lower, double f_lower, double x_upper, double f_upper);
44     int (*iterate) (void *state, gsl_function * f, double * x_minimum, double * f_minimum, double * x_lower, double * f_lower, double * x_upper, double * f_upper);
45   }
46 gsl_min_fminimizer_type;
47
48 typedef struct
49   {
50     const gsl_min_fminimizer_type * type;
51     gsl_function * function ;
52     double x_minimum ;
53     double x_lower ;
54     double x_upper ;
55     double f_minimum, f_lower, f_upper;
56     void *state;
57   }
58 gsl_min_fminimizer;
59
60 gsl_min_fminimizer *
61 gsl_min_fminimizer_alloc (const gsl_min_fminimizer_type * T) ;
62                                       
63 void gsl_min_fminimizer_free (gsl_min_fminimizer * s);
64
65 int gsl_min_fminimizer_set (gsl_min_fminimizer * s, 
66                             gsl_function * f, double x_minimum, 
67                             double x_lower, double x_upper);
68
69 int gsl_min_fminimizer_set_with_values (gsl_min_fminimizer * s, 
70                                         gsl_function * f, 
71                                         double x_minimum, double f_minimum,
72                                         double x_lower, double f_lower,
73                                         double x_upper, double f_upper);
74
75 int gsl_min_fminimizer_iterate (gsl_min_fminimizer * s);
76
77 const char * gsl_min_fminimizer_name (const gsl_min_fminimizer * s);
78
79 double gsl_min_fminimizer_x_minimum (const gsl_min_fminimizer * s);
80 double gsl_min_fminimizer_x_lower (const gsl_min_fminimizer * s);
81 double gsl_min_fminimizer_x_upper (const gsl_min_fminimizer * s);
82 double gsl_min_fminimizer_f_minimum (const gsl_min_fminimizer * s);
83 double gsl_min_fminimizer_f_lower (const gsl_min_fminimizer * s);
84 double gsl_min_fminimizer_f_upper (const gsl_min_fminimizer * s);
85
86 /* Deprecated, use x_minimum instead */
87 double gsl_min_fminimizer_minimum (const gsl_min_fminimizer * s);
88
89 int
90 gsl_min_test_interval (double x_lower, double x_upper, double epsabs, double epsrel);
91
92 GSL_VAR const gsl_min_fminimizer_type  * gsl_min_fminimizer_goldensection;
93 GSL_VAR const gsl_min_fminimizer_type  * gsl_min_fminimizer_brent;
94
95 typedef
96 int (*gsl_min_bracketing_function)(gsl_function *f,
97                                    double *x_minimum,double * f_minimum,
98                                    double *x_lower, double * f_lower,
99                                    double *x_upper, double * f_upper,
100                                    size_t eval_max);
101
102 int 
103 gsl_min_find_bracket(gsl_function *f,double *x_minimum,double * f_minimum,
104                      double *x_lower, double * f_lower,
105                      double *x_upper, double * f_upper,
106                      size_t eval_max);
107
108 __END_DECLS
109
110 #endif /* __GSL_MIN_H__ */