Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / min / test.c
1 /* min/test.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19 #include <config.h>
20 #include <stdlib.h>
21 #include <gsl/gsl_math.h>
22 #include <gsl/gsl_min.h>
23 #include <gsl/gsl_errno.h>
24 #include <gsl/gsl_test.h>
25 #include <gsl/gsl_ieee_utils.h>
26
27 #include "test.h"
28 #include "min.h"
29
30 /* stopping parameters */
31
32 const double EPSABS = 0.001 ;
33 const double EPSREL = 0.001 ;
34
35 const unsigned int MAX_ITERATIONS = 100;
36
37 void my_error_handler (const char *reason, const char *file,
38                        int line, int err);
39
40 #define WITHIN_TOL(a, b, epsrel, epsabs) \
41  (fabs((a) - (b)) < (epsrel) * GSL_MIN(fabs(a), fabs(b)) + (epsabs))
42
43 int
44 main (void)
45 {
46   gsl_function F_cos, F_func1, F_func2, F_func3, F_func4;
47   
48   const gsl_min_fminimizer_type * fminimizer[4] ;
49   const gsl_min_fminimizer_type ** T;
50
51   gsl_ieee_env_setup ();
52
53   fminimizer[0] = gsl_min_fminimizer_goldensection;
54   fminimizer[1] = gsl_min_fminimizer_brent;
55   fminimizer[2] = 0;
56
57   F_cos = create_function (f_cos) ;
58   F_func1 = create_function (func1) ;
59   F_func2 = create_function (func2) ;
60   F_func3 = create_function (func3) ;
61   F_func4 = create_function (func4) ;
62
63   gsl_set_error_handler (&my_error_handler);
64
65   for (T = fminimizer ; *T != 0 ; T++)
66     {
67       test_f (*T, "cos(x) [0 (3) 6]", &F_cos, 0.0, 3.0, 6.0, M_PI);
68       test_f (*T, "x^4 - 1 [-3 (-1) 17]", &F_func1, -3.0, -1.0, 17.0, 0.0);
69       test_f (*T, "sqrt(|x|) [-2 (-1) 1.5]", &F_func2, -2.0, -1.0, 1.5, 0.0);
70       test_f (*T, "func3(x) [-2 (3) 4]", &F_func3, -2.0, 3.0, 4.0, 1.0);
71       test_f (*T, "func4(x) [0 (0.782) 1]", &F_func4, 0, 0.782, 1.0, 0.8);
72
73       test_f_e (*T, "invalid range check [4, 0]", &F_cos, 4.0, 3.0, 0.0, M_PI);
74       test_f_e (*T, "invalid range check [1, 1]", &F_cos, 1.0, 1.0, 1.0, M_PI);
75       test_f_e (*T, "invalid range check [-1, 1]", &F_cos, -1.0, 0.0, 1.0, M_PI);
76     }
77   test_bracket("cos(x) [1,2]",&F_cos,1.0,2.0,15);
78   test_bracket("sqrt(|x|) [-1,0]",&F_func2,-1.0,0.0,15);
79   test_bracket("sqrt(|x|) [-1,-0.6]",&F_func2,-1.0,-0.6,15);
80   test_bracket("sqrt(|x|) [-1,1]",&F_func2,-1.0,1.0,15);
81
82   exit (gsl_test_summary ());
83 }
84
85 void
86 test_f (const gsl_min_fminimizer_type * T, 
87         const char * description, gsl_function *f,
88         double lower_bound, double middle, double upper_bound, 
89         double correct_minimum)
90 {
91   int status;
92   size_t iterations = 0;
93   double m, a, b;
94   double x_lower, x_upper;
95   gsl_min_fminimizer * s;
96
97   x_lower = lower_bound;
98   x_upper = upper_bound;
99
100   s = gsl_min_fminimizer_alloc (T) ;
101   gsl_min_fminimizer_set (s, f, middle, x_lower, x_upper) ;
102   
103   do 
104     {
105       iterations++ ;
106
107       status = gsl_min_fminimizer_iterate (s);
108
109       m = gsl_min_fminimizer_x_minimum(s);
110       a = gsl_min_fminimizer_x_lower(s);
111       b = gsl_min_fminimizer_x_upper(s);
112
113 #ifdef DEBUG
114       printf("%.12f %.18f %.12f %.18f %.12f %.18f status=%d\n", 
115              a, GSL_FN_EVAL(f, a), m, GSL_FN_EVAL(f, m), b, GSL_FN_EVAL(f, b), status);
116 #endif
117
118       if (a > b)
119         gsl_test (GSL_FAILURE, "interval is invalid (%g,%g)", a, b);
120
121       if (m < a || m > b)
122         gsl_test (GSL_FAILURE, "m lies outside interval %g (%g,%g)", m, a, b);
123
124       if (status) break ;
125
126       status = gsl_min_test_interval (a, b, EPSABS, EPSREL);
127     }
128   while (status == GSL_CONTINUE && iterations < MAX_ITERATIONS);
129
130   gsl_test (status, "%s, %s (%g obs vs %g expected) ", 
131             gsl_min_fminimizer_name(s), description, 
132             gsl_min_fminimizer_x_minimum(s), correct_minimum);
133
134   /* check the validity of the returned result */
135
136   if (!WITHIN_TOL (m, correct_minimum, EPSREL, EPSABS))
137     {
138       gsl_test (GSL_FAILURE, "incorrect precision (%g obs vs %g expected)", 
139                 m, correct_minimum);
140     }
141
142   gsl_min_fminimizer_free (s);
143
144 }
145
146 void
147 test_f_e (const gsl_min_fminimizer_type * T, 
148           const char * description, gsl_function *f,
149           double lower_bound, double middle, double upper_bound, 
150           double correct_minimum)
151 {
152   int status;
153   size_t iterations = 0;
154   double x_lower, x_upper;
155   double a, b;
156   gsl_min_fminimizer * s;
157
158   x_lower = lower_bound;
159   x_upper = upper_bound;
160
161   s = gsl_min_fminimizer_alloc (T) ;
162   status = gsl_min_fminimizer_set (s, f, middle, x_lower, x_upper) ; 
163
164   if (status != GSL_SUCCESS) 
165     {
166       gsl_min_fminimizer_free (s) ;
167       gsl_test (status == GSL_SUCCESS, "%s, %s", T->name, description);
168       return ;
169     }
170
171   do 
172     {
173       iterations++ ;
174       gsl_min_fminimizer_iterate (s);
175       a = gsl_min_fminimizer_x_lower(s);
176       b = gsl_min_fminimizer_x_upper(s);
177
178       status = gsl_min_test_interval (a, b, EPSABS, EPSREL);
179     }
180   while (status == GSL_CONTINUE && iterations < MAX_ITERATIONS);
181
182   gsl_test (!status, "%s, %s", gsl_min_fminimizer_name(s), description, 
183             gsl_min_fminimizer_x_minimum(s) - correct_minimum);
184
185   gsl_min_fminimizer_free (s);
186 }
187
188 void
189 my_error_handler (const char *reason, const char *file, int line, int err)
190 {
191   if (0)
192     printf ("(caught [%s:%d: %s (%d)])\n", file, line, reason, err);
193 }
194
195 int
196 test_bracket (const char * description,gsl_function *f,double lower_bound, 
197               double upper_bound, unsigned int max)
198 {
199   int status;
200   double x_lower, x_upper;
201   double f_upper,f_lower,f_minimum;
202   double x_minimum;
203
204   x_lower=lower_bound;
205   x_upper=upper_bound;
206   SAFE_FUNC_CALL (f,x_lower,&f_lower);
207   SAFE_FUNC_CALL (f,x_upper,&f_upper);
208   status=gsl_min_find_bracket(f,&x_minimum,&f_minimum,&x_lower,&f_lower,&x_upper,&f_upper,max);
209   gsl_test (status,"%s, interval: [%g,%g], values: (%g,%g), minimum at: %g, value: %g",
210             description,x_lower,x_upper,f_lower,f_upper,x_minimum,f_minimum);
211   return status;
212 }
213
214
215