Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / multifit / fsolver.c
1 /* multifit/fsolver.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <stdlib.h>
22 #include <string.h>
23 #include <gsl/gsl_errno.h>
24 #include <gsl/gsl_multifit_nlin.h>
25
26 gsl_multifit_fsolver *
27 gsl_multifit_fsolver_alloc (const gsl_multifit_fsolver_type * T, 
28                             size_t n, size_t p) 
29 {
30   int status;
31
32   gsl_multifit_fsolver * s;
33
34   if (n < p)
35     {
36       GSL_ERROR_VAL ("insufficient data points, n < p", GSL_EINVAL, 0);
37     }
38
39   s = (gsl_multifit_fsolver *) malloc (sizeof (gsl_multifit_fsolver));
40
41   if (s == 0)
42     {
43       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for multifit solver struct",
44                         GSL_ENOMEM, 0);
45     }
46
47   s->x = gsl_vector_calloc (p);
48
49   if (s->x == 0) 
50     {
51       free (s);
52       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for x", GSL_ENOMEM, 0);
53     }
54
55   s->f = gsl_vector_calloc (n);
56
57   if (s->f == 0) 
58     {
59       gsl_vector_free (s->x);
60       free (s);
61       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for f", GSL_ENOMEM, 0);
62     }
63
64   s->dx = gsl_vector_calloc (p);
65
66   if (s->dx == 0) 
67     {
68       gsl_vector_free (s->x);
69       gsl_vector_free (s->f);
70       free (s);
71       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for dx", GSL_ENOMEM, 0);
72     }
73
74   s->state = malloc (T->size);
75
76   if (s->state == 0)
77     {
78       gsl_vector_free (s->dx);
79       gsl_vector_free (s->x);
80       gsl_vector_free (s->f);
81       free (s);         /* exception in constructor, avoid memory leak */
82       
83       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for multifit solver state",
84                         GSL_ENOMEM, 0);
85     }
86
87   s->type = T ;
88
89   status = (s->type->alloc)(s->state, n, p);
90
91   if (status != GSL_SUCCESS)
92     {
93       (s->type->free)(s->state);
94       free (s->state);
95       gsl_vector_free (s->dx);
96       gsl_vector_free (s->x);
97       gsl_vector_free (s->f);
98       free (s);         /* exception in constructor, avoid memory leak */
99       
100       GSL_ERROR_VAL ("failed to set solver", status, 0);
101     }
102   
103   s->function = NULL;
104
105   return s;
106 }
107
108 int
109 gsl_multifit_fsolver_set (gsl_multifit_fsolver * s, 
110                           gsl_multifit_function * f, 
111                           const gsl_vector * x)
112 {
113   if (s->f->size != f->n)
114     {
115       GSL_ERROR ("function size does not match solver", GSL_EBADLEN);
116     }
117
118   if (s->x->size != x->size)
119     {
120       GSL_ERROR ("vector length does not match solver", GSL_EBADLEN);
121     }  
122   
123   s->function = f;
124   gsl_vector_memcpy(s->x,x);
125   
126   return (s->type->set) (s->state, s->function, s->x, s->f, s->dx);
127 }
128
129 int
130 gsl_multifit_fsolver_iterate (gsl_multifit_fsolver * s)
131 {
132   return (s->type->iterate) (s->state, s->function, s->x, s->f, s->dx);
133 }
134
135 void
136 gsl_multifit_fsolver_free (gsl_multifit_fsolver * s)
137 {
138   (s->type->free) (s->state);
139   free (s->state);
140   gsl_vector_free (s->dx);
141   gsl_vector_free (s->x);
142   gsl_vector_free (s->f);
143   free (s);
144 }
145
146 const char *
147 gsl_multifit_fsolver_name (const gsl_multifit_fsolver * s)
148 {
149   return s->type->name;
150 }
151
152 gsl_vector *
153 gsl_multifit_fsolver_position (const gsl_multifit_fsolver * s)
154 {
155   return s->x;
156 }