Added MACS source
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / ode-initval / rkf45.c
1 /* ode-initval/rkf45.c
2  * 
3  * Copyright (C) 2001, 2004, 2007 Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 /* Runge-Kutta-Fehlberg 4(5)*/
21
22 /* Reference eg. Hairer, E., Norsett S.P., Wanner, G. Solving ordinary
23    differential equations I, Nonstiff Problems, 2nd revised edition,
24    Springer, 2000.
25 */
26
27 #include <config.h>
28 #include <stdlib.h>
29 #include <string.h>
30 #include <gsl/gsl_errno.h>
31 #include <gsl/gsl_odeiv.h>
32
33 #include "odeiv_util.h"
34
35 /* Runge-Kutta-Fehlberg coefficients. Zero elements left out */
36
37 static const double ah[] = { 1.0/4.0, 3.0/8.0, 12.0/13.0, 1.0, 1.0/2.0 };
38 static const double b3[] = { 3.0/32.0, 9.0/32.0 };
39 static const double b4[] = { 1932.0/2197.0, -7200.0/2197.0, 7296.0/2197.0};
40 static const double b5[] = { 8341.0/4104.0, -32832.0/4104.0, 29440.0/4104.0, -845.0/4104.0};
41 static const double b6[] = { -6080.0/20520.0, 41040.0/20520.0, -28352.0/20520.0, 9295.0/20520.0, -5643.0/20520.0};
42
43 static const double c1 = 902880.0/7618050.0;
44 static const double c3 = 3953664.0/7618050.0;
45 static const double c4 = 3855735.0/7618050.0;
46 static const double c5 = -1371249.0/7618050.0;
47 static const double c6 = 277020.0/7618050.0;
48
49 /* These are the differences of fifth and fourth order coefficients
50    for error estimation */
51
52 static const double ec[] = { 0.0,
53   1.0 / 360.0,
54   0.0,
55   -128.0 / 4275.0,
56   -2197.0 / 75240.0,
57   1.0 / 50.0,
58   2.0 / 55.0
59 };
60
61 typedef struct
62 {
63   double *k1;
64   double *k2;
65   double *k3;
66   double *k4;
67   double *k5;
68   double *k6;
69   double *y0;
70   double *ytmp;
71 }
72 rkf45_state_t;
73
74 static void *
75 rkf45_alloc (size_t dim)
76 {
77   rkf45_state_t *state = (rkf45_state_t *) malloc (sizeof (rkf45_state_t));
78
79   if (state == 0)
80     {
81       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for rkf45_state", GSL_ENOMEM);
82     }
83
84   state->k1 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
85
86   if (state->k1 == 0)
87     {
88       free (state);
89       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for k1", GSL_ENOMEM);
90     }
91
92   state->k2 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
93
94   if (state->k2 == 0)
95     {
96       free (state->k1);
97       free (state);
98       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for k2", GSL_ENOMEM);
99     }
100
101   state->k3 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
102
103   if (state->k3 == 0)
104     {
105       free (state->k2);
106       free (state->k1);
107       free (state);
108       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for k3", GSL_ENOMEM);
109     }
110
111   state->k4 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
112
113   if (state->k4 == 0)
114     {
115       free (state->k3);
116       free (state->k2);
117       free (state->k1);
118       free (state);
119       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for k4", GSL_ENOMEM);
120     }
121
122   state->k5 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
123
124   if (state->k5 == 0)
125     {
126       free (state->k4);
127       free (state->k3);
128       free (state->k2);
129       free (state->k1);
130       free (state);
131       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for k5", GSL_ENOMEM);
132     }
133
134   state->k6 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
135
136   if (state->k6 == 0)
137     {
138       free (state->k5);
139       free (state->k4);
140       free (state->k3);
141       free (state->k2);
142       free (state->k1);
143       free (state);
144       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for k6", GSL_ENOMEM);
145     }
146
147   state->y0 = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
148
149   if (state->y0 == 0)
150     {
151       free (state->k6);
152       free (state->k5);
153       free (state->k4);
154       free (state->k3);
155       free (state->k2);
156       free (state->k1);
157       free (state);
158       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for y0", GSL_ENOMEM);
159     }
160
161   state->ytmp = (double *) malloc (dim * sizeof (double));
162
163   if (state->ytmp == 0)
164     {
165       free (state->y0);
166       free (state->k6);
167       free (state->k5);
168       free (state->k4);
169       free (state->k3);
170       free (state->k2);
171       free (state->k1);
172       free (state);
173       GSL_ERROR_NULL ("failed to allocate space for ytmp", GSL_ENOMEM);
174     }
175
176   return state;
177 }
178
179
180 static int
181 rkf45_apply (void *vstate,
182             size_t dim,
183             double t,
184             double h,
185             double y[],
186             double yerr[],
187             const double dydt_in[],
188             double dydt_out[], const gsl_odeiv_system * sys)
189 {
190   rkf45_state_t *state = (rkf45_state_t *) vstate;
191
192   size_t i;
193
194   double *const k1 = state->k1;
195   double *const k2 = state->k2;
196   double *const k3 = state->k3;
197   double *const k4 = state->k4;
198   double *const k5 = state->k5;
199   double *const k6 = state->k6;
200   double *const ytmp = state->ytmp;
201   double *const y0 = state->y0;
202
203   DBL_MEMCPY (y0, y, dim);
204
205   /* k1 step */
206   if (dydt_in != NULL)
207     {
208       DBL_MEMCPY (k1, dydt_in, dim);
209     }
210   else
211     {
212       int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t, y, k1);
213       
214       if (s != GSL_SUCCESS)
215         {
216           return s;
217         }
218     }
219   
220   for (i = 0; i < dim; i++)
221     ytmp[i] = y[i] +  ah[0] * h * k1[i];
222
223   /* k2 step */
224   {
225     int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t + ah[0] * h, ytmp, k2);
226
227     if (s != GSL_SUCCESS)
228       {
229         return s;
230       }
231   }
232   
233   for (i = 0; i < dim; i++)
234     ytmp[i] = y[i] + h * (b3[0] * k1[i] + b3[1] * k2[i]);
235
236   /* k3 step */
237   {
238     int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t + ah[1] * h, ytmp, k3);
239     
240     if (s != GSL_SUCCESS)
241       {
242         return s;
243       }
244   }
245   
246   for (i = 0; i < dim; i++)
247     ytmp[i] = y[i] + h * (b4[0] * k1[i] + b4[1] * k2[i] + b4[2] * k3[i]);
248
249   /* k4 step */
250   {
251     int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t + ah[2] * h, ytmp, k4);
252
253     if (s != GSL_SUCCESS)
254       {
255         return s;
256       }
257   }
258   
259   for (i = 0; i < dim; i++)
260     ytmp[i] =
261       y[i] + h * (b5[0] * k1[i] + b5[1] * k2[i] + b5[2] * k3[i] +
262                   b5[3] * k4[i]);
263
264   /* k5 step */
265   {
266     int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t + ah[3] * h, ytmp, k5);
267
268     if (s != GSL_SUCCESS)
269       {
270         return s;
271       }
272   }
273   
274   for (i = 0; i < dim; i++)
275     ytmp[i] =
276       y[i] + h * (b6[0] * k1[i] + b6[1] * k2[i] + b6[2] * k3[i] +
277                   b6[3] * k4[i] + b6[4] * k5[i]);
278
279   /* k6 step and final sum */
280   {
281     int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t + ah[4] * h, ytmp, k6);
282
283     if (s != GSL_SUCCESS)
284       {
285         return s;
286       }
287   }
288   
289   for (i = 0; i < dim; i++)
290     {
291       const double d_i = c1 * k1[i] + c3 * k3[i] + c4 * k4[i] + c5 * k5[i] + c6 * k6[i];
292       y[i] += h * d_i;
293     }
294
295   /* Derivatives at output */
296
297   if (dydt_out != NULL)
298     {
299       int s = GSL_ODEIV_FN_EVAL (sys, t + h, y, dydt_out);
300       
301       if (s != GSL_SUCCESS)
302         {
303           /* Restore initial values */
304           DBL_MEMCPY (y, y0, dim);
305
306           return s;
307         }
308     }
309   
310   /* difference between 4th and 5th order */
311   for (i = 0; i < dim; i++)
312     {
313       yerr[i] = h * (ec[1] * k1[i] + ec[3] * k3[i] + ec[4] * k4[i] 
314                      + ec[5] * k5[i] + ec[6] * k6[i]);
315     }
316      
317   return GSL_SUCCESS;
318 }
319
320
321 static int
322 rkf45_reset (void *vstate, size_t dim)
323 {
324   rkf45_state_t *state = (rkf45_state_t *) vstate;
325
326   DBL_ZERO_MEMSET (state->k1, dim);
327   DBL_ZERO_MEMSET (state->k2, dim);
328   DBL_ZERO_MEMSET (state->k3, dim);
329   DBL_ZERO_MEMSET (state->k4, dim);
330   DBL_ZERO_MEMSET (state->k5, dim);
331   DBL_ZERO_MEMSET (state->k6, dim);
332   DBL_ZERO_MEMSET (state->ytmp, dim);
333   DBL_ZERO_MEMSET (state->y0, dim);
334
335   return GSL_SUCCESS;
336 }
337
338 static unsigned int
339 rkf45_order (void *vstate)
340 {
341   rkf45_state_t *state = (rkf45_state_t *) vstate;
342   state = 0; /* prevent warnings about unused parameters */
343   return 5;
344 }
345
346 static void
347 rkf45_free (void *vstate)
348 {
349   rkf45_state_t *state = (rkf45_state_t *) vstate;
350
351   free (state->ytmp);
352   free (state->y0);
353   free (state->k6);
354   free (state->k5);
355   free (state->k4);
356   free (state->k3);
357   free (state->k2);
358   free (state->k1);
359   free (state);
360 }
361
362 static const gsl_odeiv_step_type rkf45_type = { "rkf45",        /* name */
363   1,                            /* can use dydt_in */
364   0,                            /* gives exact dydt_out */
365   &rkf45_alloc,
366   &rkf45_apply,
367   &rkf45_reset,
368   &rkf45_order,
369   &rkf45_free
370 };
371
372 const gsl_odeiv_step_type *gsl_odeiv_step_rkf45 = &rkf45_type;