htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/permutation/init.c

   1 /* permutation/init.c
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
   4  *
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
   7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
   8  * your option) any later version.
   9  *
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
  11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  13  * General Public License for more details.
  14  *
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18  */
  19
  20 #include <config.h>
  21 #include <stdlib.h>
  22 #include <gsl/gsl_errno.h>
  23 #include <gsl/gsl_permutation.h>
  24
  25 gsl_permutation *
  26 gsl_permutation_alloc (const size_t n)
  27 {
  28   gsl_permutation * p;
  29
  30   if (n == 0)
  31     {
  32       GSL_ERROR_VAL ("permutation length n must be positive integer",
  33                         GSL_EDOM, 0);
  34     }
  35
  36   p = (gsl_permutation *) malloc (sizeof (gsl_permutation));
  37
  38   if (p == 0)
  39     {
  40       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for permutation struct",
  41                         GSL_ENOMEM, 0);
  42     }
  43
  44   p->data = (size_t *) malloc (n * sizeof (size_t));
  45
  46   if (p->data == 0)
  47     {
  48       free (p);         /* exception in constructor, avoid memory leak */
  49
  50       GSL_ERROR_VAL ("failed to allocate space for permutation data",
  51                         GSL_ENOMEM, 0);
  52     }
  53
  54   p->size = n;
  55
  56   return p;
  57 }
  58
  59 gsl_permutation *
  60 gsl_permutation_calloc (const size_t n)
  61 {
  62   size_t i;
  63
  64   gsl_permutation * p =  gsl_permutation_alloc (n);
  65
  66   if (p == 0)
  67     return 0;
  68
  69   /* initialize permutation to identity */
  70
  71   for (i = 0; i < n; i++)
  72     {
  73       p->data[i] = i;
  74     }
  75
  76   return p;
  77 }
  78
  79 void
  80 gsl_permutation_init (gsl_permutation * p)
  81 {
  82   const size_t n = p->size ;
  83   size_t i;
  84
  85   /* initialize permutation to identity */
  86
  87   for (i = 0; i < n; i++)
  88     {
  89       p->data[i] = i;
  90     }
  91 }
  92
  93 void
  94 gsl_permutation_free (gsl_permutation * p)
  95 {
  96   free (p->data);
  97   free (p);
  98 }