htswanalysis/MACS/lib/gsl/gsl-1.11/permutation/permutation.c

   1 /* permutation/permutation.c
   2  *
   3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 Brian Gough
   4  *
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   6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
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  16  * along with this program; if not, write to the Free Software
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
  18  */
  19
  20 #include <config.h>
  21 #include <gsl/gsl_errno.h>
  22 #include <gsl/gsl_permutation.h>
  23
  24 size_t
  25 gsl_permutation_size (const gsl_permutation * p)
  26 {
  27   return p->size ;
  28 }
  29
  30 size_t *
  31 gsl_permutation_data (const gsl_permutation * p)
  32 {
  33   return p->data ;
  34 }
  35
  36 #ifndef HIDE_INLINE_STATIC
  37 size_t
  38 gsl_permutation_get (const gsl_permutation * p, const size_t i)
  39 {
  40   if (gsl_check_range)
  41     {
  42       if (i >= p->size)         /* size_t is unsigned, can't be negative */
  43         {
  44           GSL_ERROR_VAL ("index out of range", GSL_EINVAL, 0);
  45         }
  46     }
  47
  48   return p->data[i];
  49 }
  50 #endif
  51
  52 int
  53 gsl_permutation_swap (gsl_permutation * p, const size_t i, const size_t j)
  54 {
  55   const size_t size = p->size ;
  56
  57   if (i >= size)
  58     {
  59       GSL_ERROR("first index is out of range", GSL_EINVAL);
  60     }
  61
  62   if (j >= size)
  63     {
  64       GSL_ERROR("second index is out of range", GSL_EINVAL);
  65     }
  66
  67   if (i != j)
  68     {
  69       size_t tmp = p->data[i];
  70       p->data[i] = p->data[j];
  71       p->data[j] = tmp;
  72     }
  73
  74   return GSL_SUCCESS;
  75 }
  76
  77
  78 int
  79 gsl_permutation_valid (const gsl_permutation * p)
  80 {
  81   const size_t size = p->size ;
  82
  83   size_t i, j ;
  84
  85   for (i = 0; i < size; i++)
  86     {
  87       if (p->data[i] >= size)
  88         {
  89           GSL_ERROR("permutation index outside range", GSL_FAILURE) ;
  90         }
  91
  92       for (j = 0; j < i; j++)
  93         {
  94           if (p->data[i] == p->data[j])
  95             {
  96               GSL_ERROR("duplicate permutation index", GSL_FAILURE) ;
  97             }
  98         }
  99     }
 100
 101   return GSL_SUCCESS;
 102 }
 103
 104 void
 105 gsl_permutation_reverse (gsl_permutation * p)
 106 {
 107   const size_t size = p->size ;
 108
 109   size_t i ;
 110
 111   for (i = 0; i < (size / 2); i++)
 112     {
 113       size_t j = size - i - 1;
 114
 115       size_t tmp = p->data[i] ;
 116       p->data[i] = p->data[j] ;
 117       p->data[j] = tmp ;
 118     }
 119 }
 120
 121 int
 122 gsl_permutation_inverse (gsl_permutation * inv, const gsl_permutation * p)
 123 {
 124   const size_t size = p->size ;
 125
 126   size_t i ;
 127
 128   if (inv->size != size)
 129     {
 130       GSL_ERROR("permutation lengths are not equal", GSL_EBADLEN);
 131     }
 132
 133   for (i = 0; i < size; i++)
 134     {
 135       inv->data[p->data[i]] = i ;
 136     }
 137
 138   return GSL_SUCCESS ;
 139 }
 140
 141 int
 142 gsl_permutation_next (gsl_permutation * p)
 143 {
 144   /* Replaces p with the next permutation (in the standard lexicographical
 145    * ordering).  Returns GSL_FAILURE if there is no next permutation.
 146    */
 147   const size_t size = p->size;
 148   size_t i, j, k;
 149
 150   if (size < 2)
 151     {
 152       return GSL_FAILURE;
 153     }
 154
 155   i = size - 2;
 156
 157   while ((p->data[i] > p->data[i+1]) && (i != 0))
 158     {
 159       i--;
 160     }
 161
 162   if ((i == 0) && (p->data[0] > p->data[1]))
 163     {
 164      return GSL_FAILURE;
 165     }
 166
 167   k = i + 1;
 168
 169   for (j = i + 2; j < size; j++ )
 170     {
 171       if ((p->data[j] > p->data[i]) && (p->data[j] < p->data[k]))
 172         {
 173           k = j;
 174         }
 175     }
 176
 177   /* swap i and k */
 178
 179   {
 180     size_t tmp = p->data[i];
 181     p->data[i] = p->data[k];
 182     p->data[k] = tmp;
 183   }
 184
 185   for (j = i + 1; j <= ((size + i) / 2); j++)
 186     {
 187       size_t tmp = p->data[j];
 188       p->data[j] = p->data[size + i - j];
 189       p->data[size + i - j] = tmp;
 190     }
 191
 192   return GSL_SUCCESS;
 193 }
 194
 195 int
 196 gsl_permutation_prev (gsl_permutation * p)
 197 {
 198   const size_t size = p->size;
 199   size_t i, j, k;
 200
 201   if (size < 2)
 202     {
 203       return GSL_FAILURE;
 204     }
 205
 206   i = size - 2;
 207
 208   while ((p->data[i] < p->data[i+1]) && (i != 0))
 209     {
 210       i--;
 211     }
 212
 213   if ((i == 0) && (p->data[0] < p->data[1]))
 214     {
 215       return GSL_FAILURE;
 216     }
 217
 218   k = i + 1;
 219
 220   for (j = i + 2; j < size; j++ )
 221     {
 222       if ((p->data[j] < p->data[i]) && (p->data[j] > p->data[k]))
 223         {
 224           k = j;
 225         }
 226     }
 227
 228   /* swap i and k */
 229
 230   {
 231     size_t tmp = p->data[i];
 232     p->data[i] = p->data[k];
 233     p->data[k] = tmp;
 234   }
 235
 236   for (j = i + 1; j <= ((size + i) / 2); j++)
 237     {
 238       size_t tmp = p->data[j];
 239       p->data[j] = p->data[size + i - j];
 240       p->data[size + i - j] = tmp;
 241     }
 242
 243   return GSL_SUCCESS;
 244 }
 245
 246 int
 247 gsl_permutation_mul (gsl_permutation * p, const gsl_permutation * pa, const gsl_permutation * pb)
 248 {
 249   size_t i;
 250   const size_t size = p->size;
 251
 252   if (pa->size != size)
 253     {
 254       GSL_ERROR("size of result does not match size of pa", GSL_EINVAL);
 255     }
 256
 257   if (pb->size != size)
 258     {
 259       GSL_ERROR("size of result does not match size of pb", GSL_EINVAL);
 260     }
 261
 262   for (i = 0; i < size; i++)
 263     {
 264       p->data[i] = pb->data[pa->data[i]];
 265     }
 266
 267   return GSL_SUCCESS;
 268 }
 269 int
 270 gsl_permutation_memcpy (gsl_permutation * dest,
 271                         const gsl_permutation * src)
 272 {
 273   const size_t src_size = src->size;
 274   const size_t dest_size = dest->size;
 275
 276   if (src_size != dest_size)
 277     {
 278       GSL_ERROR ("permutation lengths are not equal", GSL_EBADLEN);
 279     }
 280
 281   {
 282     size_t j;
 283
 284     for (j = 0; j < src_size; j++)
 285       {
 286         dest->data[j] = src->data[j];
 287       }
 288   }
 289
 290   return GSL_SUCCESS;
 291 }