Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / randist / beta.c
1 /* randist/beta.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_math.h>
23 #include <gsl/gsl_rng.h>
24 #include <gsl/gsl_randist.h>
25 #include <gsl/gsl_sf_gamma.h>
26
27 /* The beta distribution has the form
28
29    p(x) dx = (Gamma(a + b)/(Gamma(a) Gamma(b))) x^(a-1) (1-x)^(b-1) dx
30
31    The method used here is the one described in Knuth */
32
33 double
34 gsl_ran_beta (const gsl_rng * r, const double a, const double b)
35 {
36   double x1 = gsl_ran_gamma (r, a, 1.0);
37   double x2 = gsl_ran_gamma (r, b, 1.0);
38
39   return x1 / (x1 + x2);
40 }
41
42 double
43 gsl_ran_beta_pdf (const double x, const double a, const double b)
44 {
45   if (x < 0 || x > 1)
46     {
47       return 0 ;
48     }
49   else 
50     {
51       double p;
52
53       double gab = gsl_sf_lngamma (a + b);
54       double ga = gsl_sf_lngamma (a);
55       double gb = gsl_sf_lngamma (b);
56       
57       if (x == 0.0 || x == 1.0) 
58         {
59           p = exp (gab - ga - gb) * pow (x, a - 1) * pow (1 - x, b - 1);
60         }
61       else
62         {
63           p = exp (gab - ga - gb + log(x) * (a - 1)  + log1p(-x) * (b - 1));
64         }
65
66       return p;
67     }
68 }