Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / randist / chisq.c
1 /* randist/chisq.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_sf_gamma.h>
23 #include <gsl/gsl_rng.h>
24 #include <gsl/gsl_randist.h>
25
26 /* The chisq distribution has the form
27
28    p(x) dx = (1/(2*Gamma(nu/2))) (x/2)^(nu/2 - 1) exp(-x/2) dx
29
30    for x = 0 ... +infty */
31
32 double
33 gsl_ran_chisq (const gsl_rng * r, const double nu)
34 {
35   double chisq = 2 * gsl_ran_gamma (r, nu / 2, 1.0);
36   return chisq;
37 }
38
39 double
40 gsl_ran_chisq_pdf (const double x, const double nu)
41 {
42   if (x <= 0)
43     {
44       return 0 ;
45     }
46   else
47     {
48       double p;
49       double lngamma = gsl_sf_lngamma (nu / 2);
50       
51       p = exp ((nu / 2 - 1) * log (x/2) - x/2 - lngamma) / 2;
52       return p;
53     }
54 }