Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / randist / logarithmic.c
1 /* randist/logarithmic.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_rng.h>
23 #include <gsl/gsl_randist.h>
24
25 /* Logarithmic distribution 
26
27    prob(n) =   p^n / (n log(1/(1-p)) for n = 1, 2, 3, ...
28
29    We use Kemp's second accelerated generator, from Luc Devroye's book
30    on "Non-Uniform Random Variate Generation", Springer */
31
32 unsigned int
33 gsl_ran_logarithmic (const gsl_rng * r, const double p)
34 {
35   double c = log (1-p) ;
36
37   double v = gsl_rng_uniform_pos (r);
38   
39   if (v >= p)
40     {
41       return 1 ;
42     }
43   else
44     {
45       double u = gsl_rng_uniform_pos (r);      
46       double q = 1 - exp (c * u);
47
48       if (v <= q*q)
49         {
50           double x = 1 + log(v)/log(q) ;
51           return x ;
52         }
53       else if (v <= q)
54         {
55           return 2;
56         }
57       else
58         {
59           return 1 ;
60         }
61     }
62 }
63
64 double
65 gsl_ran_logarithmic_pdf (const unsigned int k, const double p)
66 {
67   if (k == 0)
68     {
69       return 0 ;
70     }
71   else 
72     {
73       double P = pow(p, (double)k) / (double) k / log(1/(1-p)) ;
74       return P;
75     }
76 }