Added script front-end for primer-design code
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / randist / lognormal.c
1 /* randist/lognormal.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_math.h>
23 #include <gsl/gsl_rng.h>
24 #include <gsl/gsl_randist.h>
25
26 /* The lognormal distribution has the form 
27
28    p(x) dx = 1/(x * sqrt(2 pi sigma^2)) exp(-(ln(x) - zeta)^2/2 sigma^2) dx
29
30    for x > 0. Lognormal random numbers are the exponentials of
31    gaussian random numbers */
32
33 double
34 gsl_ran_lognormal (const gsl_rng * r, const double zeta, const double sigma)
35 {
36   double u, v, r2, normal, z;
37
38   do
39     {
40       /* choose x,y in uniform square (-1,-1) to (+1,+1) */
41
42       u = -1 + 2 * gsl_rng_uniform (r);
43       v = -1 + 2 * gsl_rng_uniform (r);
44
45       /* see if it is in the unit circle */
46       r2 = u * u + v * v;
47     }
48   while (r2 > 1.0 || r2 == 0);
49
50   normal = u * sqrt (-2.0 * log (r2) / r2);
51
52   z =  exp (sigma * normal + zeta);
53
54   return z;
55 }
56
57 double
58 gsl_ran_lognormal_pdf (const double x, const double zeta, const double sigma)
59 {
60   if (x <= 0)
61     {
62       return 0 ;
63     }
64   else
65     {
66       double u = (log (x) - zeta)/sigma;
67       double p = 1 / (x * fabs(sigma) * sqrt (2 * M_PI)) * exp (-(u * u) /2);
68       return p;
69     }
70 }