Added MACS source
[htsworkflow.git] / htswanalysis / MACS / lib / gsl / gsl-1.11 / randist / pascal.c
1 /* randist/pascal.c
2  * 
3  * Copyright (C) 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2007 James Theiler, Brian Gough
4  * 
5  * This program is free software; you can redistribute it and/or modify
6  * it under the terms of the GNU General Public License as published by
7  * the Free Software Foundation; either version 3 of the License, or (at
8  * your option) any later version.
9  * 
10  * This program is distributed in the hope that it will be useful, but
11  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
13  * General Public License for more details.
14  * 
15  * You should have received a copy of the GNU General Public License
16  * along with this program; if not, write to the Free Software
17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA 02110-1301, USA.
18  */
19
20 #include <config.h>
21 #include <math.h>
22 #include <gsl/gsl_rng.h>
23 #include <gsl/gsl_randist.h>
24
25 /* The Pascal distribution is a negative binomial with valued integer n
26
27    prob(k) =  (n - 1 + k)!/(n!(k - 1)!) *  p^n (1-p)^k for k = 0, 1, ..., n
28
29    */
30
31 unsigned int
32 gsl_ran_pascal (const gsl_rng * r, double p, unsigned int n)
33 {
34   /* This is a separate interface for the pascal distribution so that
35      it can be optimized differently from the negative binomial in
36      future.
37      
38      e.g. if n < 10 it might be faster to generate the Pascal
39      distributions as the sum of geometric variates directly.  */
40   
41   unsigned int k = gsl_ran_negative_binomial (r, p, (double) n);
42   return k;
43 }
44
45 double
46 gsl_ran_pascal_pdf (const unsigned int k, const double p, unsigned int n)
47 {
48   double P = gsl_ran_negative_binomial_pdf (k, p, (double) n);
49   return P;
50 }